针对市政工程采购非法石料的问题，核心处理方向如下：

1. 行政责任层面

   • 根据《中华人民共和国招标投标法》第五十九条，若采购过程中存在串通投标、弄虚作假等违法行为，行政主管部门可责令改正，处中标项目金额5‰以上10‰以下的罚款；对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员处单位罚款数额5%以上10%以下的罚款。
     
   • 若石料来源涉及非法采矿（如无采矿许可证），根据《矿产资源法》第三十九条，可没收违法所得，并处违法所得50%以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
     
   • 处理建议：立即停止使用非法石料，向行政主管部门（如住建局、自然资源局）主动报告，配合调查并补办合法手续（如更换供应商、补缴税费等），争取从轻处理。
     

2. 民事责任层面

   • 若因使用非法石料导致工程质量问题（如强度不达标、耐久性不足），建设单位可能面临对第三方（如业主、使用方）的违约赔偿。根据《民法典》第五百七十七条，需承担修理、重作、减少价款或赔偿损失等责任。
     
   • 处理建议：委托第三方检测机构对工程质量进行鉴定，留存证据；若已造成损失，与受损方协商赔偿方案，避免诉讼扩大损失。
     

3. 刑事责任层面

   • 若采购行为涉及“单位行贿”“非法经营”等犯罪（如为获取低价石料向供应商行贿，或明知石料为盗采仍大量采购），根据《刑法》第三百九十三条（单位行贿罪）或第二百二十五条（非法经营罪），直接负责的主管人员和其他直接责任人员可能被处五年以下有期徒刑或拘役，并处罚金。
     
   • 处理建议：立即停止与涉事供应商的合作，内部核查是否存在利益输送或知情不报的情况；若已收到司法机关调查通知，需配合调查并委托律师介入。
     

4. 内部管理层面

   • 市政工程通常涉及公共资金，采购非法石料可能违反《政府采购法》第七十七条（如以不合理的条件对供应商实行差别待遇），需对采购流程进行合规审查，完善供应商准入、验收、付款等环节的制度。
     
   • 处理建议：修订内部采购管理制度，明确石料质量标准（如要求提供采矿许可证、检验报告）；对涉事人员（如采购负责人、验收人员）进行问责，必要时调整岗位。
     

总结：市政工程采购非法石料需从行政、民事、刑事、内部管理四方面同步处理，核心原则是“停止使用、主动报告、补救损失、完善制度”。若涉及具体案件（如已收到行政处罚决定书或刑事立案通知），需进一步提供细节，我可协助分析证据链及辩护策略。