不起诉单位并不意味着员工一定不会被开除，是否会被开除取决于员工行为是否严重违反公司规章制度、造成重大损失或恶劣影响，以及公司内部政策的具体规定。以下从不同角度进行详细分析：

一、员工行为严重违反公司规章制度

如果员工的行为尽管尚未到达应被诉讼的地步，但已经严重触犯了公司的规章制度，例如严重违反职业道德、泄露公司机密、贪污受贿等，那么公司仍然有权利做出将其辞退的决策。这种情况下，不起诉并不影响公司依据内部规章制度对员工进行纪律处分，包括开除。

举例：某公司员工利用职务之便，私自将公司客户信息出售给竞争对手，虽然该行为未达到刑事犯罪的程度，未被起诉，但严重违反了公司的保密制度和职业道德，公司有权依据规章制度将其开除。

二、员工行为给公司造成重大损失或恶劣影响

如果员工的行为给公司带来了巨大的经济损失或恶劣的社会影响，即使未达到诉讼程度，公司也可能考虑开除该员工。这是因为员工的行为已经严重损害了公司的利益和形象，公司为了维护自身权益和声誉，可能会采取严厉的纪律措施。

举例：某公司员工在操作过程中因疏忽大意导致公司重大设备损坏，造成数百万元的经济损失，虽然该员工未被起诉，但公司可能认为其不再适合继续留在公司，从而选择开除。

三、公司内部政策的具体规定

公司内部政策对于员工的行为规范和纪律处分有明确的规定。如果公司政策中明确规定了某些行为将导致开除，且这些行为并未达到诉讼程度，那么公司有权依据政策对员工进行开除处理。

举例：某公司政策规定，员工在一年内累计迟到超过一定次数将被开除。如果某员工在一年内累计迟到次数超过了规定，即使未被起诉，公司也有权依据政策将其开除。

四、法律建议与风险提示

1. 了解公司规章制度：员工应详细了解并遵守公司的规章制度，避免因违反规定而被开除。
2. 保留证据：如果员工认为公司的开除决定不合理或违法，应保留相关证据，如公司规章制度、开除通知、工作记录等，以便在需要时维护自己的权益。
3. 寻求法律帮助：如果员工对公司的开除决定有异议，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。

风险提示：不起诉并不意味着员工的行为没有问题或不会被公司处理。公司有权依据内部规章制度和政策对员工进行纪律处分，包括开除。因此，员工应时刻注意自己的行为举止，遵守公司规定和法律法规，以免给自己带来不必要的麻烦和损失。

如果有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。