民警半夜上门检查毛发是否合法，需结合具体情况与法律规定综合判断，但一般情况下，若符合法定程序与条件，则合法；反之，则可能不合法。以下从不同角度进行分析：

1. 法律依据与程序要求

根据《中华人民共和国治安管理处罚法》及相关规定，公安机关为维护社会治安秩序，有权对特定场所、人员进行检查。然而，这种检查必须遵循法定程序，包括但不限于：

• 出示证件：民警在执行检查任务时，必须向被检查人出示工作证件，表明身份。
• 说明理由：民警应向被检查人说明检查的目的、依据及范围。
• 遵守时间限制：虽然法律未明确规定检查的具体时间，但检查行为应合理、必要，避免对被检查人的正常生活造成不必要的干扰。半夜上门检查，若无紧急情况或特殊理由，可能被视为不合理。

2. 检查毛发的合法性

检查毛发通常与毒品检测相关，属于公安机关在办理毒品案件时的侦查手段之一。其合法性取决于：

• 是否有合法依据：如民警怀疑某人涉嫌吸毒或贩毒，且有合理理由认为检查毛发能获取相关证据，则检查行为可能具有合法性。
• 是否遵循法定程序：包括上述的出示证件、说明理由等。
• 是否侵犯合法权益：检查行为不得侵犯被检查人的隐私权、人身自由等合法权益。半夜上门检查，若未遵循法定程序或侵犯了被检查人的合法权益，则可能不合法。

3. 特殊情况下的合法性

在某些特殊情况下，如紧急追捕逃犯、防止重大犯罪发生等，民警可能需要在非工作时间进行上门检查。此时，检查行为的合法性可能得到更宽泛的解释，但仍需遵循法定程序并尽量减少对被检查人的干扰。

4. 被检查人的权利

作为被检查人，您有权：

• 要求民警出示证件：确认其身份和检查的合法性。
• 询问检查理由：了解检查的目的和依据。
• 拒绝非法检查：若民警未遵循法定程序或侵犯了您的合法权益，您有权拒绝检查，并可向公安机关或相关部门投诉。

5. 法律后果

• 若检查合法：则被检查人应配合检查，否则可能面临法律责任。
• 若检查不合法：被检查人可向公安机关或相关部门投诉，要求纠正错误行为，并可依法追究相关人员的法律责任。

建议：若您遇到民警半夜上门检查毛发的情况，首先要求民警出示证件并说明检查理由。若认为检查行为不合法或侵犯了您的合法权益，可拒绝检查并立即向公安机关或相关部门投诉。同时，保留相关证据（如录音、录像等）以便后续维权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。