若原告使用不合法文件起诉，法院通常不会采纳该证据，案件可能因证据不足被驳回，或原告需承担举证不能的法律后果。具体分析如下：

1. 法院对证据合法性的审查
   根据《民事诉讼法》及相关司法解释，法院在立案和审理阶段会对证据的合法性进行审查。若原告提交的文件存在伪造、变造、违反法律强制性规定（如未经公证的遗嘱、非法获取的录音等），法院会依法排除该证据，并可能对原告进行训诫或罚款。例如，若原告提交的合同系伪造，法院可依据《民事诉讼法》第114条对其处以罚款。

2. 案件处理结果

   • 证据不足驳回：若不合法文件是案件关键证据，法院可能因证据不足驳回原告诉求。
     
   • 举证不能后果：原告需承担因证据不合法导致的败诉风险，包括诉讼费、对方律师费等（若合同或法律有约定）。
     
   • 刑事责任风险：若原告伪造证据情节严重（如伪造国家机关公文），可能涉嫌《刑法》第280条的伪造国家机关公文罪，面临刑事处罚。

3. 被告的应对措施

   • 提出异议：在答辩状或庭审中明确指出证据不合法，要求法院排除。
     
   • 申请鉴定：对有争议的文件申请笔迹、公章等鉴定，固定证据。
     
   • 反诉或举报：若发现原告伪造证据，可向法院提起反诉或向公安机关报案。

建议：若您是被告，收到起诉材料后应立即核对证据合法性，必要时委托律师协助审查。如有疑问，可直接向我咨询具体应对方案。