针对您提出的“以运输合同损害保险公司利益是否可以作为拒赔理由”的问题，我们需要从多个角度进行深入分析。

首先，要明确的是，保险公司是否拒赔，主要取决于保险合同的条款以及事故的具体情况，而非单纯基于运输合同是否损害了保险公司的利益。在运输合同中，如果货物因运输公司的过失（如疲劳驾驶导致车辆侧翻）而受损，且该运输公司已在保险公司投保了相应的货物损失责任险，那么赔偿责任的判定需依据保险合同的具体内容。

保险公司可能拒赔的情况

1. 保险事故不属于保单保障范围：

   • 如果保险合同中明确排除了某些类型的损失或事故，而实际发生的事故恰好属于这些被排除的情况，保险公司有权拒赔。

2. 免除责任事项：

   • 保险合同中通常会列出一些免除保险公司责任的事项，如战争、核辐射、被保险人故意行为等。如果事故是由这些免除责任事项引起的，保险公司同样有权拒赔。

3. 未遵守保险合同中的特定条款：

   • 保险合同中可能包含一些特定的条款，如要求被保险人在事故发生后及时通知保险公司、提供必要的证明文件等。如果被保险人未能遵守这些条款，保险公司可能拒绝赔偿。

4. 事故为被保险人故意行为所致：

   • 根据《中华人民共和国保险法》的相关规定，如果事故是由被保险人的故意行为（如自杀、故意犯罪等）引起的，保险公司不承担赔偿责任。

运输合同与保险公司利益的关系

• 合同的相对性：

  • 运输服务合同的当事人是托运人和运输公司，保险公司并非该合同的当事人。因此，从合同相对性的角度来看，保险公司是否承担赔偿责任并不直接取决于运输合同是否损害了其利益。

• 保险法的规定：

  • 根据《中华人民共和国保险法》的相关规定，责任保险的被保险人给第三者造成损害时，保险公司可以根据法律的规定或合同的约定直接向第三者赔偿保险金。但这并不意味着保险公司会无条件地承担赔偿责任，而是需要依据保险合同的具体条款和事故情况来判断。

实际案例分析

以您提供的案例为例，法院最终判决运输公司承担赔偿责任，而驳回了原告对保险公司的诉讼请求。这是因为原告选择的是运输服务民法典律关系提起诉讼，根据合同的相对性原则，保险公司并非该合同的当事人。同时，在起诉时赔偿责任尚未确定，原告直接要求保险公司承担赔偿责任缺乏依据。

结论

综上所述，以运输合同损害保险公司利益并不能直接作为保险公司拒赔的理由。保险公司是否拒赔主要取决于保险合同的条款以及事故的具体情况。如果事故属于保险合同的保障范围且被保险人遵守了合同中的所有条款，那么保险公司通常需要承担赔偿责任。反之，如果事故不属于保障范围或被保险人违反了合同条款，保险公司则有权拒赔。