人民调解协议加盖有公章，但只有职工一人签字（同当事人签字）的情况下，其法律效力存在不确定性，需根据具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 形式要件角度

• 通常情形：根据《人民调解法》及相关司法实践，调解协议需双方当事人签字或盖章方能生效。若仅一方签字（即使加盖公章），另一方未签字，则表明另一方未认可调解内容，协议未达成双方合意，形式上存在瑕疵，可能被认定为无效。
• 例外情形：若签字方已实际履行协议义务（如支付赔偿款），而另一方以未签字为由拒绝履行，法院可能综合双方沟通记录、履行情况等因素，认定协议具有法律效力。例如，甲与乙达成调解，甲签字后履行了义务，乙未签字但拒绝履行，法院可能判定协议有效。

2. 公章效力角度

• 公章的作用：公章代表单位或组织的意志，但调解协议的本质是双方合意。若职工签字系代表单位或组织，且公章真实有效，可能增强协议的证明力。但若职工无权代表单位签字，或公章使用不规范，仍可能影响协议效力。
• 需结合授权：若职工签字系职务行为，需提供授权委托书或单位认可的证据，否则仅凭公章和职工签字，难以直接认定协议有效。

3. 实际履行角度

• 履行对效力的影响：若一方已按协议履行主要义务（如支付款项、交付物品），另一方未提出异议或接受履行，法院可能推定双方达成合意，认定协议有效。但若另一方明确拒绝履行并主张协议无效，法院需审查签字真实性、公章效力及履行情况。

4. 法律建议

• 完善形式要件：为避免纠纷，建议调解协议由双方当事人亲自签字或盖章，并注明签字人身份（如法定代表人、授权代表）。若职工代签，需附授权委托书。
• 保留履行证据：若已部分履行协议，务必保留转账记录、收条、沟通记录等证据，以证明双方实际合意。
• 及时补正或确认：若发现协议形式瑕疵，可要求另一方补签或出具书面确认函，完善法律效力。

5. 可能的法律后果

• 协议无效：若另一方主张协议未生效，且无实际履行或补正证据，法院可能判定协议无效，双方需重新协商或通过诉讼解决纠纷。
• 协议有效：若存在实际履行或另一方默认接受，法院可能认定协议有效，要求违约方继续履行或赔偿损失。

总结：人民调解协议的效力需结合形式要件、实际履行及双方意思表示综合判断。若仅职工一人签字且加盖公章，但另一方未签字，协议效力存在风险。建议完善签字手续或保留履行证据，以降低法律风险。如有具体案件，可进一步提供细节，我将为您详细分析。