双方协商还款协议后，是否还可以立案，需分情况讨论：

一、若对方已按还款协议全面履行义务

1. 通常不能再次立案：在民事纠纷中，双方达成还款协议并全面履行完毕后，意味着纠纷已得到妥善解决。此时，若权利人再次就同一事项提起诉讼，法院一般会依据“一事不再理”原则不予立案。这是为了维护司法的效率和稳定性，避免重复处理同一纠纷。
2. 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，对判决、裁定、调解书已经发生法律效力的案件，当事人又起诉的，告知原告申请再审，但法院准许撤诉的裁定除外。这体现了司法对已决事项的尊重，防止司法资源的浪费。

二、若对方未按还款协议全面履行义务

1. 可以就未履行部分再次起诉：如果对方仅履行了部分还款义务，或者完全未履行还款协议，那么权利人有权就未履行部分再次向法院提起诉讼。这是因为法律保障当事人的合法权利，当权利受到侵害时，当事人有权利通过合法途径寻求救济。
2. 申请强制执行：除了再次起诉外，权利人还可以根据已生效的还款协议，向法院申请强制执行。法院会依法对被执行人的财产进行查封、扣押、冻结等措施，以强制其履行还款义务。
3. 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，发生法律效力的民事判决、裁定，当事人必须履行。一方拒绝履行的，对方当事人可以向人民法院申请执行。这为权利人提供了法律上的保障。

三、若出现新的事实或证据

1. 可以再次起诉：如果在双方达成还款协议后，又出现了新的事实或证据，例如发现对方在协议签订时有故意隐瞒重要财产等行为，或者对方在协议履行过程中有新的违约行为，那么权利人可以基于这些新的事实或证据再次向法院提起诉讼。
2. 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，原告起诉时需要有具体的事实和理由。当新的事实或证据出现时，原有的纠纷状态发生了改变，构成了新的诉请基础，因此法院一般会立案受理。

建议与提醒：

• 在签订还款协议时，务必明确约定还款金额、还款时间、违约责任等条款，以确保协议的明确性和可执行性。
• 若对方未按协议履行义务，应及时收集证据并咨询专业律师，以便采取合适的法律措施维护自身权益。
• 在诉讼过程中，要遵守诉讼程序和相关法律规定，确保诉讼行为的合法性和有效性。

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