已经立案的案件，双方仍然可以协商还款额。在债务债权纠纷中，即使案件已经进入司法程序，双方当事人仍然有权在法庭的主持下或者自行进行协商，以达成和解协议，包括对还款额的调整。
协商还款的法律基础
自愿原则：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，民事诉讼应当遵循自愿原则。这意味着，在诉讼过程中，双方当事人有权自主决定是否进行和解，以及和解的具体内容，包括还款额的调整。
调解制度：在诉讼过程中，法院通常会鼓励双方当事人进行调解，以达成和解协议。调解是一种灵活、高效的解决纠纷方式，它允许双方当事人在法院的主持下，就争议事项进行协商，并达成双方都能接受的解决方案。如果双方能够就还款额达成一致，法院可以制作调解书，该调解书具有与判决书同等的法律效力。
协商还款的注意事项
确保协议合法有效：在协商还款时，双方应当确保所达成的协议内容合法、有效，不违反法律法规的强制性规定。例如，还款额的调整应当合理，不得存在欺诈、胁迫等情形。
书面形式确认：为了保障双方的权益，建议将协商达成的还款协议以书面形式确认下来，并由双方签字或盖章。这样，在后续的执行过程中，如果发生争议，可以作为有力的证据。
及时告知法院：如果双方在诉讼过程中达成了和解协议，应当及时告知法院，以便法院根据协议内容制作调解书或者裁定准许撤诉。这样，可以确保协议的顺利执行，并避免不必要的诉讼成本。
协商还款可能面临的法律后果
调解书具有强制执行力：如果双方在法院的主持下达成调解协议，并由法院制作调解书，那么该调解书具有与判决书同等的法律效力。如果一方不履行调解书确定的义务，另一方可以向法院申请强制执行。
撤诉后可能面临的风险：如果双方在诉讼过程中达成和解协议，并决定撤诉，那么撤诉后，如果一方不履行协议约定的义务，另一方可能需要重新提起诉讼来维护自己的权益。因此，在撤诉前，双方应当充分考虑各种风险，并确保协议内容得到切实履行。
建议：在已经立案的债务债权纠纷中，如果双方希望协商还款额，可以积极与对方进行沟通，并在法院的主持下或者自行达成和解协议。在协商过程中，应当确保协议内容合法、有效，并及时告知法院。如果遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。