员工违规违纪，公司一般不可以直接给员工停薪留职。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、停薪留职的法律规定与适用性

停薪留职通常指的是员工因特定原因（如个人创业、学习深造等）暂时离开工作岗位，但保留与公司的劳动关系，期间不发放工资。然而，在劳动法框架下，停薪留职并非公司可以随意对员工采取的措施，它通常需要基于双方的协商一致，并且可能受到特定行业规定或公司内部规章制度的约束。对于员工违规违纪的情况，停薪留职并非法定的处理方式。

二、员工违规违纪的处理方式

当员工出现违规违纪行为时，公司应依据相关法律法规和公司内部规章制度进行处理。常见的处理方式包括：

1. 警告或记过：对于轻微的违规违纪行为，公司可以给予员工警告或记过处分，以示警戒。
2. 降职或降薪：对于较为严重的违规违纪行为，公司可以考虑对员工进行降职或降薪处理。
3. 解除劳动合同：对于严重违反公司规章制度或法律法规的员工，公司有权解除劳动合同。

停薪留职并不属于上述法定处理方式之一。如果公司未经员工同意，擅自决定停薪留职，可能构成违法行为，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

三、公司应如何合法处理员工违规违纪

1. 完善规章制度：公司应制定完善的规章制度，明确员工的行为规范和违规违纪的处理方式。
2. 依法处理：在处理员工违规违纪行为时，公司应严格遵守相关法律法规和公司内部规章制度，确保处理方式的合法性和合理性。
3. 与员工沟通：在处理过程中，公司应与员工进行充分沟通，了解员工的想法和意见，尽量通过协商解决问题。
4. 保留证据：公司应妥善保留员工违规违纪的证据，以便在需要时进行举证。

四、可能的法律后果

如果公司未经员工同意擅自决定停薪留职，可能面临以下法律后果：

1. 支付工资及经济补偿：员工有权要求公司支付停薪留职期间的工资及可能的经济补偿。
2. 恢复劳动关系：如果停薪留职导致劳动关系解除，员工有权要求恢复劳动关系。
3. 行政处罚：公司可能因违反劳动法律法规而受到劳动监察部门的行政处罚。

建议：公司在处理员工违规违纪行为时，应严格遵守相关法律法规和公司内部规章制度，确保处理方式的合法性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。