核心结论：工程保修期内甲方自行委托维修单位维修的，费用承担及责任划分需结合保修协议、合同条款及法律规定综合判断，具体分以下情况处理：

1. 若保修协议明确约定“甲方有权自行维修并追偿费用”

根据《民法典》第五百七十七条（当事人一方不履行合同义务，应承担继续履行、采取补救措施或赔偿损失等违约责任），若乙方（承包方）在保修期内未按约定履行维修义务，甲方有权依据协议委托第三方维修，并要求乙方承担合理维修费用。
关键点：

• 维修费用需“合理”，即与市场价相当，且维修范围属于保修责任范围（如因乙方施工质量问题导致的损坏）。
  
• 甲方需保留维修合同、付款凭证、维修记录等证据，证明费用实际发生且与乙方违约直接相关。
  

2. 若保修协议未约定或约定不明

需结合《建设工程质量管理条例》第四十一条（建设工程在保修范围和保修期限内发生质量问题的，施工单位应当履行保修义务，并对造成的损失承担赔偿责任）及《民法典》合同编相关规定处理：

• 甲方通知义务：甲方应先书面通知乙方履行维修义务，并留存通知证据（如EMS邮寄凭证、短信/邮件记录）。
  
• 乙方拒不维修：若乙方在合理期限内未响应，甲方可自行维修，但需确保维修方案合理、费用必要。
  
• 费用追偿：甲方可要求乙方承担维修费用，但需证明质量问题属乙方责任（如通过鉴定报告），且费用未超出必要范围。
  

3. 若质量问题非乙方责任

若损坏系因甲方使用不当、第三方原因或不可抗力导致，乙方不承担保修责任，甲方自行委托维修的费用需自行承担。
例外：若合同约定乙方需承担部分非自身责任维修费用（如特定情形下的“兜底条款”），则按合同执行。

实务建议

1. 优先协商：甲方可先与乙方沟通，明确维修责任及费用承担方式，避免纠纷升级。
   
2. 固定证据：维修前需拍照、录像记录损坏情况，维修后保留发票、合同等凭证。
   
3. 法律途径：若协商无果，甲方可向法院起诉，要求乙方承担维修费用及违约金（如有约定）。
   

提示：工程保修期责任划分需结合具体合同条款及证据，建议根据实际情况进一步分析。若有具体案例或合同文本，可直接向我咨询细节。