生产假冒伪劣化肥的行为，主要由市场监督管理部门和农业农村部门负责处理。以下是对此问题的详细分析：
一、市场监督管理部门
监管职责：
- 市场监督管理部门是假冒伪劣产品监管的核心部门，负责查处生产、销售不符合保障人体健康和人身、财产安全的国家标准、行业标准的产品，以及以次充好、以假充真等各类违法行为。
执法措施：
- 对生产、销售假冒伪劣化肥的行为，市场监督管理部门有权进行查处，包括对相关生产经营场所进行检查，查封、扣押有证据证明是假冒伪劣的产品及用于生产、销售这些产品的工具、设备、原材料等物品。
- 依据《中华人民共和国产品质量法》的相关规定，对掺杂、掺假，以假充真，以次充好，或者以不合格产品冒充合格产品的行为，责令停止生产、销售，没收违法生产、销售的产品，并处违法生产、销售产品货值金额百分之五十以上三倍以下的罚款；有违法所得的，并处没收违法所得；情节严重的，吊销营业执照；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
二、农业农村部门
监管职责：
- 农业农村部门主要负责农资产品，如假农药、假兽药、假化肥等的监督管理。其职责在于保障农业生产资料的质量，维护农民的合法权益。
执法措施：
- 对生产、销售假冒伪劣化肥的行为，农业农村部门有权依据《肥料登记管理办法》等相关法规进行查处。例如，对未取得登记证、假冒伪造登记证号或产品成分不符的行为，给予警告，并处违法所得三倍以下（最高不超过三万元）或一万元以下的罚款。
三、其他可能的处理部门及协作机制
公安机关：
- 若生产、销售假冒伪劣化肥的行为情节严重，构成犯罪，则公安机关将依法介入，追究相关人员的刑事责任。依据《中华人民共和国刑法》的相关规定，生产、销售假化肥，使生产遭受较大损失的，将处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金；造成重大或特别重大损失的，将面临更严厉的刑罚。
协作机制：
- 在处理生产假冒伪劣化肥的行为时，各部门之间将形成协作机制，共同维护市场秩序和消费者权益。例如，市场监督管理部门在查处过程中发现涉嫌犯罪的，将及时移送公安机关处理。
建议与提醒：
- 对于生产者而言，应严格遵守相关法律法规，确保产品质量，避免生产假冒伪劣化肥。
- 对于消费者而言，若发现生产、销售假冒伪劣化肥的行为，应及时向市场监督管理部门或农业农村部门举报，以维护自身权益和市场秩序。
- 若有任何关于生产假冒伪劣化肥的法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我将提供专业的法律意见和帮助。