若甲方认为工程合同中的印章造假，这确实是一个需要谨慎处理的问题，因为它可能直接影响到合同的效力和双方的权利义务。以下是从不同角度给出的分析和建议：

1. 印章真伪的鉴定：

   • 鉴定程序：首先，如果甲方对印章的真实性有异议，应当通过合法的鉴定程序来确定印章的真伪。这通常涉及将合同上的印章与甲方备案的公章进行比对，或者通过专业的鉴定机构进行鉴定。
   • 鉴定结果的影响：如果鉴定结果显示印章是真实的，那么甲方的异议将不成立，合同将继续有效。如果鉴定结果显示印章是伪造的，那么合同可能因缺乏真实意思表示而被认定为无效或可撤销。

2. 合同效力的认定：

   • 真实意思表示：合同的效力取决于双方是否基于真实的意思表示达成合意。如果印章是伪造的，且甲方能够证明其并未授权使用该印章，那么合同可能因缺乏甲方的真实意思表示而被认定为无效。
   • 表见代理的例外：然而，如果乙方有理由相信使用伪造印章的人有权代表甲方签订合同（如表见代理），且乙方在签订合同时是善意的、无过失的，那么合同可能仍然有效。这种情况下，甲方可能需要承担合同责任，但可以向使用伪造印章的人追偿。

3. 法律后果与应对措施：

   • 合同无效的后果：如果合同被认定为无效，双方应当返还因合同取得的财产，无法返还或没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失。
   • 应对措施：
     • 收集证据：无论甲方还是乙方，都应当积极收集与合同签订、履行相关的证据，以证明自己的主张。
     • 协商解决：在争议发生后，双方可以尝试通过协商的方式解决争议，以避免不必要的法律纠纷和成本。
     • 法律途径：如果协商无果，双方可以通过法律途径解决争议，如提起诉讼或申请仲裁。

4. 预防与风险控制：

   • 印章管理：甲方应当加强印章的管理，确保印章的安全和合法使用。避免将印章交予未经授权的人员使用，防止印章被伪造或滥用。
   • 合同审查：在签订合同前，双方应当对合同的内容进行仔细审查，确保合同条款的明确性和合法性。同时，可以对对方的身份和授权情况进行核实，以降低合同风险。

针对您的情况，我建议您首先与甲方进行沟通，了解其对印章造假的具体指控和证据。然后，您可以考虑通过合法的鉴定程序来确定印章的真伪。如果鉴定结果显示印章是真实的，那么您可以要求甲方继续履行合同；如果鉴定结果显示印章是伪造的，那么您需要根据具体情况来评估合同的效力，并采取相应的应对措施。

在整个过程中，如果您需要任何法律帮助或建议，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业的法律意见和解决方案。