以房抵债协议在符合法定优先权条件、在建工程抵押权未有效设立或存在权利瑕疵、以及以房抵债协议合法有效且已实际履行的情况下，可以对抗在建抵押。以下是对这几种情况的详细分析：

1. 符合法定优先权条件

• 法律依据：根据《民法典》及相关司法解释，某些特定情形下的债权可能享有法定优先权，如建设工程价款优先受偿权、消费者购房权等。
• 分析：若以房抵债的债权属于上述享有法定优先权的范畴，且该优先权在时间上、条件上均符合法律规定，则该以房抵债协议可能具有对抗在建工程抵押权的效力。例如，若以房抵债是为了清偿建设工程价款，且该价款享有优先受偿权，那么在建设工程价款优先受偿权范围内，以房抵债协议可以对抗在建工程抵押权。

2. 在建工程抵押权未有效设立或存在权利瑕疵

• 法律依据：根据《民法典》关于抵押权设立的规定，抵押权自登记时设立。若在建工程抵押权未办理抵押登记，或登记存在瑕疵，则抵押权可能未有效设立。
• 分析：
  • 未办理抵押登记：若开发商未就其正在建造的在建工程办理抵押登记，则该在建工程抵押权未设立，以房抵债协议自然可以对抗一个不存在的抵押权。
  • 登记瑕疵：若在建工程抵押权登记存在瑕疵，如抵押物范围不明确、抵押权人身份错误等，可能导致抵押权无效或可撤销。在此情况下，以房抵债协议也可能具有对抗效力。

3. 以房抵债协议合法有效且已实际履行

• 法律依据：根据《民法典》关于合同效力的规定，依法成立的合同，自成立时生效。若以房抵债协议系双方真实意思表示，且不违反法律、行政法规的强制性规定，则该协议合法有效。
• 分析：
  • 协议合法有效：若以房抵债协议合法有效，且双方已按照协议约定履行了各自义务，如债务人已将房屋交付给债权人，债权人已接受该房屋并办理了相关手续，则该以房抵债协议具有法律约束力。
  • 对抗在建抵押：在此情况下，若在建工程抵押权设立时间晚于以房抵债协议的履行时间，或虽设立时间早但存在其他影响其效力的因素（如抵押权人同意以房抵债等），则以房抵债协议可能具有对抗在建工程抵押权的效力。

注意事项与建议

• 审查协议与抵押的合法性：在签订以房抵债协议前，务必审查协议的合法性和有效性，以及在建工程抵押权的设立情况。
• 及时办理过户手续：若以房抵债协议合法有效且双方已履行各自义务，应及时办理房屋过户手续，以确保债权人的权益得到充分保障。
• 咨询专业律师：由于涉及复杂的法律关系和权益冲突，建议在签订以房抵债协议或处理相关纠纷时咨询专业律师，以获取更准确的法律意见和帮助。

在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同，因此，在处理具体案件时，还需要结合案件的具体事实和证据进行综合分析。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。