违法发放贷款罪不能通过自诉方式在法院提起诉讼，该罪行属于公诉案件范畴，由人民检察院提起公诉。以下是对此问题的详细分析：

一、违法发放贷款罪的性质

违法发放贷款罪，作为《中华人民共和国刑法》分则明确规定的罪名，其侵害的是国家的金融管理秩序和金融机构的财产权益。这类犯罪行为对社会的危害性较大，且往往涉及复杂的金融操作和广泛的利益关系，因此，对这类犯罪行为的查处需遵循公诉案件的办理流程，由检察机关代表国家追究被告人的刑事责任。

二、公诉与自诉的区别

1. 公诉：由检察机关代表国家对犯罪嫌疑人提起诉讼，追究其刑事责任。公诉案件通常涉及社会公共利益，且犯罪行为较为严重。
2. 自诉：由被害人或其法定代理人直接向人民法院提起诉讼，要求追究被告人的刑事责任。自诉案件通常涉及公民个人之间的权益纠纷，且犯罪行为相对较轻。

三、违法发放贷款罪的立案与追诉程序

1. 案件发现与报案：银行等金融机构自查发现违法发放贷款行为，或金融监管部门检查发现违规问题，以及社会公众、借款人或其他利益相关人向相关部门报案。
2. 公安机关侦查：接到报案或线索后，公安机关进行立案前的初步调查。认为存在犯罪事实且需要追究刑事责任时，正式立案侦查，并收集相关证据，查明违法发放贷款的具体情况。
3. 检察机关审查起诉：公安机关侦查终结后，将案件移送人民检察院审查起诉。人民检察院全面审查案件，包括证据是否确实、充分，犯罪嫌疑人的行为是否构成违法发放贷款罪等，并决定是否向人民法院提起公诉。
4. 法院审理与判决：人民法院受理检察机关提起的公诉后，对案件进行审理，并听取控辩双方意见。根据事实和法律作出判决。

四、特殊情形下的处理

虽然违法发放贷款罪主要通过公诉程序处理，但在特殊情况下，如被害人有证据证明而公安机关或人民检察院不予追究时，理论上被害人可以直接向人民法院提起自诉。然而，这种情况在实际司法实践中较为少见，因为违法发放贷款罪往往涉及复杂的金融操作和广泛的利益关系，且犯罪行为较为严重，更适合通过公诉程序进行查处。

五、法律建议

对于涉嫌违法发放贷款的行为，建议相关金融机构和人员及时自查并整改，以避免触犯法律。同时，社会公众和借款人等利益相关人若发现此类违法行为，应及时向相关部门报案，以维护自身权益和社会公共利益。

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