针对您提出的“自诉后公诉机关提起公诉，案件怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确自诉案件和公诉案件的基本区别。自诉案件通常是由被害人或其法定代理人直接向法院提起诉讼，而公诉案件则是由检察院代表国家对犯罪嫌疑人提起诉讼。在正常情况下，这两者是分开的，但偶尔也会出现自诉案件被按公诉程序处理的情况。

当自诉案件被按公诉程序处理时，处理流程如下：

1. 侦查阶段：

   • 如果您认为案件属于自诉范畴，可以向侦查机关说明情况，并请求撤销案件。这是您的合法权利，侦查机关应当予以考虑。
   • 然而，如果侦查机关未予理会，案件可能会继续进入审查起诉阶段。

2. 审查起诉阶段：

   • 在此阶段，您可以向检察院提出案件应属自诉的意见。
   • 检察院会对案件进行审查，如果认定案件属于告诉才处理的范畴（即自诉案件），检察院可能会作出不起诉决定。

3. 审判阶段：

   • 如果案件已经进入审判阶段，被告人（即原自诉案件中的被告）可以依据法律规定，以该案件应属自诉为由进行抗辩，要求法院终止审理。
   • 同时，作为被害人，如果您符合自诉条件，也可以直接向法院提起自诉。法院在审查后，如果确定为自诉案件，会按照自诉程序重新审理。

在处理过程中，需要注意以下几点：

• 被告人权利保障：在整个处理过程中，被告人的权利应当得到充分保障。例如，被告人有权获得辩护，以确保自身合法权益得到维护。
• 证据要求：公诉程序对于证据的要求更为严格，必须形成完整的证据链。因此，在处理过程中，证据的收集和呈现至关重要。
• 法律程序遵循：无论是自诉还是公诉，都必须严格遵循法律程序。任何违反法律程序的行为都可能导致案件处理结果的不公正。

司法实践中的情况：

在司法实践中，自诉案件被按公诉程序处理的情况并不多见。这主要是因为自诉案件和公诉案件在性质、处理方式和法律依据上都有明显的区别。然而，一旦出现这种情况，就需要根据案件的具体事实和证据来确定处理办法。

综上所述，当自诉案件被按公诉程序处理时，您可以通过向侦查机关说明情况、向检察院提出意见以及在审判阶段进行抗辩或直接提起自诉等方式来维护自己的合法权益。同时，也需要注意被告人权利保障、证据要求和法律程序遵循等方面的问题。希望这些解答能够对您有所帮助。如果您还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时咨询。