针对您提出的“农村土地私下转让协议写永久转让有效吗？合法吗？”这一问题，我将结合相关法律法规，为您进行详细解答。
一、永久转让条款的无效性
首先，需要明确的是，农村土地转让合同中约定永久转让的条款通常是无效的。这是因为：
法律依据：根据《中华人民共和国农村土地承包法》的规定，耕地的承包期为三十年，草地为三十年至五十年，林地为三十年至七十年。土地经营权流转应遵循依法、自愿、有偿原则，且流转期限不得超过承包期的剩余期限。这意味着承包地的流转具有明确的时间限制，永久转让违反了这一法律规定。
无效原因：永久转让协议违背了农村土地的集体所有制性质以及土地承包经营权的相关规定，损害了农村集体和其他成员的利益。这种协议因违反法律的强制性规定而无效，一旦发生纠纷，法院可能会认定该协议无效，转让行为也可能不受法律保护。
二、合法转让方式
为了确保土地流转的合法性和有效性，农民在进行土地转让时，应遵循以下合法方式：
主体限制：农用土地使用权转让的主体一般限于本集体经济组织内部成员。
发包方同意：土地流转需经发包方同意，确保程序的合法性。
规划与用途管制：土地流转应符合土地利用总体规划和用途管制要求，不得擅自改变土地用途。
受让方资格：受让方应具备农业经营能力，确保土地用于农业生产。
不得损害权益：土地流转不得损害国家、集体和他人合法权益。
三、合同部分无效的处理
如果农村土地转让合同中约定了永久转让，但其他条款符合法律规定，不影响合同其他部分效力的，其他部分仍然有效。合同双方应对无效部分进行修改和调整，重新约定符合法律规定的流转期限等内容，以确保合同的合法性和有效性。若双方无法就修改达成一致，可视为不定期流转，任意一方在合理催告后有权解除合同。
四、总结与建议
综上所述，农村土地转让合同中的永久转让条款通常是无效的。在进行土地流转时，务必遵守相关法律法规，确保转让行为的合法性和有效性。为了保障您的权益，我建议您：
明确土地性质：在签订转让协议前，明确土地是承包经营权还是宅基地使用权。
遵循法定程序：按照法律规定的程序进行土地流转，包括向发包方备案、履行必要的审批手续等。
咨询专业律师：对于涉及复杂法律问题的土地流转，建议咨询专业律师以确保协议的合法性和有效性。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时与我联系。