租车进院后车辆被扣是否违法，需根据扣车主体、扣车原因及法律依据综合判断。以下从不同角度分析：

1. 若扣车主体为租车公司，需区分合法与非法情形

• 合法扣车：若租车合同中明确约定“车辆不得进入特定区域（如医院、学校等）”，或约定“车辆被扣时租车公司有权收回”，且租车公司能证明车辆因违规进入导致被扣（如医院规定禁止外部车辆进入），则扣车可能被认定为合法。但需注意：
  • 合同条款需明确且不违反法律强制性规定；
  • 租车公司需通过合法程序（如通知租车人、协商解决）收回车辆，而非直接扣留。
• 非法扣车：若合同无相关约定，或租车公司无法证明车辆违规进入，直接扣车可能构成侵权。租车人可要求返还车辆，并主张因扣车导致的损失（如误工费、交通费）。

2. 若扣车主体为医院等第三方，需判断其是否有权扣车

• 无权扣车：医院、学校等公共场所通常无权扣留他人车辆。若车辆因违规进入被暂扣，第三方应联系交警或相关部门处理，而非自行扣车。擅自扣车可能构成侵权，租车人可报警或起诉要求返还车辆并赔偿损失。
• 特殊情形：若车辆因违法（如闯入禁行区、肇事逃逸）被交警依法扣留，则属于合法行政强制措施，与租车行为无关。

3. 若扣车行为涉及违法犯罪，需承担法律责任

• 非法扣留他人财物：根据《治安管理处罚法》第四十九条，盗窃、诈骗、哄抢、抢夺、敲诈勒索或者故意损毁公私财物的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款；情节较重的，处十日以上十五日以下拘留，可以并处一千元以下罚款。若扣车行为被认定为非法，扣车人可能面临行政处罚或民事赔偿。
• 刑事责任：若扣车过程中伴随暴力、威胁等手段，可能构成《刑法》第二百六十三条规定的抢劫罪，或第二百七十五条规定的故意毁坏财物罪，需承担刑事责任。

法律建议

1. 核实扣车主体及依据：要求扣车方出示合法扣车的依据（如合同条款、行政处罚决定书），若无法提供，可拒绝扣车并报警。
2. 保留证据：拍照、录像记录扣车过程，保存租车合同、缴费凭证等材料，以便后续维权。
3. 协商或诉讼：若扣车行为违法，可先与扣车方协商解决；协商不成，可向法院起诉要求返还车辆并赔偿损失。

总结：租车进院后车辆被扣是否违法，关键在于扣车主体是否有权、扣车原因是否合法。若遇到非法扣车，建议及时维权，避免损失扩大。如有具体案情，可进一步向我咨询。