针对您提出的“以房抵工程款，施工单位如何排除执行”的问题，这是一个涉及法律程序和权益保障的重要议题。下面，我将从法律依据、排除执行的条件、特殊情况考虑以及具体措施和程序等方面，为您进行详细、有深度的解答。
一、法律依据
在探讨以房抵工程款能否排除执行的问题时，我们主要依据的是《最高人民法院关于人民法院办理执行异议和复议案件若干问题的规定》（以下简称《执行异议复议规定》）。特别是其中的第28条和第29条，为判断此类情况提供了明确的法律标准。
二、排除执行的条件
要成功排除以房抵工程款的强制执行，施工单位通常需要满足以下条件：
合法有效的书面买卖合同：
- 在人民法院查封之前，施工单位与建设单位（或相关债务人）已签订书面的房屋买卖合同，该合同需内容合法、有效，且明确房屋位置、价格及付款方式等关键条款。
实际占有不动产：
- 施工单位需在法院查封前实际占有该房屋，这可以通过物业交接单、水电费缴纳记录、装修合同等证据来证明。
支付价款情况：
- 施工单位需证明工程款债权真实存在，且抵债房产价值与原债权相当。这通常需要提供工程结算文件、评估报告等证据。在以房抵债的情况下，可以视为已支付全部价款（或等价支付）。
非因自身原因未办理过户：
- 未能办理过户登记不是因为施工单位的过错，而是由于开发商拖延、政策限制、房屋抵押或其他客观原因导致。
三、特殊情况考虑
建设工程价款优先受偿权：
- 如果以房抵债是为了实现工程款优先受偿权（根据《民法典》第807条），且符合相关条件（如工程款债权经生效裁判确认或结算文件明确、抵债协议在工程款履行期满后签订、抵债房产是工程款债权的“物化载体”等），则可能优先排除执行。
消费者购房权益保护：
- 需要注意的是，工程款债权人通常不被认定为“消费者”，因此一般无法适用《执行异议复议规定》第29条中关于商品房消费者的更宽松条件。
四、具体措施和程序
完善协议与证据链：
- 施工单位应确保与建设单位签订的以房抵债协议合法有效，并转化为书面买卖合同。同时，保存好工程结算文件、债务确认书等证据，以证明债权真实性及抵债等价性。
及时占有并推动过户：
- 在查封前完成房屋交付，并留存相关凭证（如物业交接单、水电费缴纳记录等）。同时，立即办理网签或预告登记，以避免开发商二次处置。
提出执行异议：
- 如果发现以房抵工程款的房产面临强制执行，施工单位应立即向法院提交书面执行异议申请，详细陈述自己的权益和理由，并提供相关证据。
积极参与听证程序：
- 在法院组织的听证会上，施工单位应充分阐述自己的观点，回应质疑，并提供必要的补充证据。
配合法院调查和审查：
- 施工单位应积极配合法院的调查工作，提供所需的信息和协助，以确保法院能够全面了解案件情况。
五、例外情形与救济措施
无法排除执行时的救济：
- 如果施工单位无法满足排除执行的条件，可以申请参与执行分配，主张抵债行为构成“已支付全部价款”，要求在执行款中优先受偿。
调解书不产生物权变动：
- 需要注意的是，即使以房抵债经法院调解书确认，未过户前仍不能排除执行。因此，施工单位应确保及时办理过户手续。
综上所述，以房抵工程款能否排除执行取决于多个因素的综合判断。施工单位应充分了解相关法律要求，并采取正确的措施和程序来保护自己的合法权益。如果面临此类问题，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。