关于有总经理签字但没有印章是否违法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”可以回答，而是需要根据具体情况来分析。
从公司内部管理角度：
- 公司的内部文件、合同或决策，其有效性往往依赖于公司内部的规章制度。如果公司章程或内部管理规定明确要求，某些文件必须同时有签字和印章才生效，那么仅有总经理签字而没有印章，该文件在公司内部可能不被视为有效。
- 反之，如果公司内部规定并未明确要求必须同时有签字和印章，或者规定签字即具有法律效力，那么仅有总经理签字的文件在公司内部可能是有效的。
从对外交易和法律效力的角度：
- 在对外交易中，特别是涉及合同等法律文件时，印章往往被视为公司身份和意愿的重要象征。然而，这并不意味着没有印章的文件就一定无效。关键在于合同双方是否认可该文件的效力，以及该文件是否符合相关法律法规的规定。
- 如果合同双方明确约定，仅有总经理签字即代表公司意愿，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么仅有总经理签字的合同可能是有效的。
- 但如果法律法规或行业规范明确要求，某些类型的合同必须同时有签字和印章才生效，那么仅有总经理签字的合同可能被视为无效或存在瑕疵。
从法律风险的角度：
- 仅有总经理签字而没有印章的文件，可能增加法律风险。因为印章在一定程度上可以证明文件的真实性和公司的认可，没有印章可能引发对方对文件真实性的质疑。
- 在涉及重大交易或法律纠纷时，对方可能更倾向于要求文件同时有签字和印章，以降低法律风险。
建议：
- 为了确保文件的法律效力和降低法律风险，建议公司在重要文件上同时加盖印章和由有权人员签字。
- 如果确实存在只能签字不能加盖印章的情况，建议公司在文件上明确说明原因，并尽可能通过其他方式（如电子邮件确认、视频会议记录等）来佐证文件的真实性和公司的认可。
- 在对外交易中，特别是涉及重大合同或法律文件时，建议事先与对方明确约定文件的生效条件和形式要求，以避免后续纠纷。
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