结论：老板通过微信直接发工资并扣税点的行为是否合法，需分情况讨论。一般情况下，扣税点本身不违法，但需确保是依法代扣代缴个人所得税；而通过微信转账发工资，只要符合工资支付规定且能证明劳动关系和工资数额，也是合法的。不过，若扣税点并非依法代扣，或者微信转账存在无法证明劳动关系和工资数额等问题，则可能违法。

一、关于扣税点

1. 依法代扣代缴：

   • 根据《中华人民共和国个人所得税法》及相关规定，雇主作为扣缴义务人，有义务依法代扣代缴员工的个人所得税。
   • 如果老板扣的“税点”实际上是依法代扣代缴的个人所得税，且税率、税额计算均符合法律规定，那么这种行为是合法的。

2. 非法扣税：

   • 如果老板扣的“税点”并非依法代扣代缴的个人所得税，而是以其他名义（如管理费、手续费等）擅自扣除员工工资的一部分，那么这种行为是违法的。
   • 员工有权要求老板返还非法扣除的部分，并可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

二、关于微信转账发工资

1. 合法性：

   • 微信转账作为一种支付方式，本身并不违法。只要老板能够证明通过微信转账的是工资，且该工资数额与劳动合同或实际工作情况相符，那么这种支付方式就是合法的。
   • 然而，需要注意的是，微信转账可能存在无法直接证明劳动关系和工资数额的问题。因此，建议老板在转账时备注清楚款项性质（如“X月工资”），并保留好相关证据（如转账记录、劳动合同、工资条等）。

2. 潜在风险：

   • 如果老板仅通过微信转账发工资，而没有其他证据（如劳动合同、工资条等）来证明劳动关系和工资数额，那么在发生劳动争议时，员工可能会面临举证困难的问题。
   • 此外，如果微信账号被盗用或转账记录被删除，也可能导致工资支付证明的缺失。

三、建议

1. 对于员工：

   • 要求老板提供完整的工资支付记录（包括转账记录、工资条等），并确保这些记录能够证明劳动关系和工资数额。
   • 如果发现老板非法扣税或未依法代扣代缴个人所得税，可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

2. 对于老板：

   • 依法代扣代缴员工的个人所得税，并确保税率、税额计算符合法律规定。
   • 在通过微信转账发工资时，备注清楚款项性质，并保留好相关证据（如转账记录、劳动合同、工资条等），以备不时之需。

总结：老板通过微信直接发工资并扣税点的行为是否合法，取决于扣税点是否依法代扣代缴以及微信转账是否能证明劳动关系和工资数额。如果有任何疑问或发现违法行为，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。