建设单位肢解分包总承包单位是违法行为，一旦查实，建设单位将面临行政处罚及可能的民事赔偿责任。以下是对此问题的详细分析：

一、法律规定与定义

根据《中华人民共和国建筑法》第二十四条，建筑工程应当提倡总承包，严禁将建筑工程肢解发包。所谓“肢解分包”，指的是建设单位将原本应由一个承包单位整体完成的建设工程，分解成若干部分后分别发包给不同的承包单位。这种行为破坏了正常的工程建设秩序，增加了工程管理的难度和风险。

二、肢解分包的认定

判断建设单位的发包行为是否构成肢解分包，需要综合考虑工程的性质、设计要求以及施工技术的关联性。例如，一栋建筑物的主体结构从基础到封顶是一个技术紧密联系、施工连贯的整体，若被拆分发包给不同施工单位，即构成肢解发包。在具体认定时，需要结合合同文件、施工图纸、施工记录等资料，并可能进行现场勘查和调查取证。

三、肢解分包的危害

1. 工程管理难度增加：多个承包单位参与同一工程，协调管理变得复杂，容易导致施工进度、顺序、质量等方面的冲突。
2. 工程质量难以保证：承包单位之间可能存在衔接配合问题，容易留下质量隐患。同时，肢解分包还可能引入不具备相应资质的承包单位，进一步加剧工程质量风险。
3. 安全风险增大：由于安全责任不明确，各承包单位可能采取不同的安全管理标准，导致施工现场存在安全隐患，易引发安全事故。
4. 工程造价失控：肢解分包可能导致招标、管理成本增加，同时交叉施工、重复计费等问题也可能导致工程造价超出预算。

四、法律后果

1. 行政处罚：依据《建设工程质量管理条例》第五十五条，建设单位将建设工程肢解发包的，将被责令改正，并处以工程合同价款0.5%以上1%以下的罚款。对于全部或者部分使用国有资金的项目，还可能暂停项目执行或者暂停资金拨付。
2. 民事赔偿责任：若肢解分包行为给其他相关方（如总承包单位、实际施工人等）造成损失，建设单位需承担相应的民事赔偿责任。这包括赔偿窝工损失、修复工程费用等。

五、应对策略与建议

作为总承包单位或相关方，在发现建设单位存在肢解分包行为时，可以采取以下措施：

1. 收集证据：包括合同文件、施工图纸、施工记录等，以证明建设单位存在肢解分包的行为。
2. 向有关部门举报：将收集到的证据提交给当地建设行政主管部门或其他相关部门，要求其对建设单位进行查处。
3. 提起诉讼：若因肢解分包行为遭受损失，可以向法院提起诉讼，要求建设单位承担民事赔偿责任。

温馨提示：建设单位肢解分包总承包单位是严重的违法行为，不仅违反了法律法规，还可能对工程质量、安全及相关方权益造成极大威胁。作为法律从业者，我建议各方应严格遵守法律法规，坚决打击此类违法行为，共同维护建筑市场的秩序和公平。如果您在此方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。