工程变更只有建设单位签字没有盖章，其有效性需分情况讨论。

1. 从合同形式要件角度分析：

   • 一般情况下，合同或变更协议需要满足法律规定的形式要件才具有法律效力。对于建设工程合同及其变更，若合同或相关法规明确规定必须采用书面形式，并且需要签字和盖章作为生效条件，那么仅有建设单位签字而未盖章的工程变更可能因形式要件不满足而被视为无效。
   • 然而，如果合同或法规并未明确规定必须同时签字和盖章，或者规定签字即代表认可，那么仅有建设单位签字的工程变更可能仍然有效。

2. 从实际履行和交易习惯角度分析：

   • 在实际工程实践中，如果双方已经按照仅有建设单位签字的工程变更内容实际履行，且没有提出异议，那么根据交易习惯和诚实信用原则，该变更可能被视为有效。
   • 此外，如果建设单位在签字后以实际行动（如支付变更部分的工程款）表明其认可变更内容，那么这也可能构成对变更有效性的确认。

3. 从法律后果和风险防范角度分析：

   • 仅有建设单位签字而未盖章的工程变更存在法律风险。一旦发生纠纷，对方可能主张变更无效，从而要求按照原合同执行。
   • 为了降低法律风险，建议在工程变更时尽量确保同时满足签字和盖章的形式要件。如果确实无法盖章，至少应确保签字人的身份和权限得到明确确认，并保留相关证据以备不时之需。

法律建议：

• 在进行工程变更时，务必仔细审查合同条款和相关法规，明确变更的形式要件和生效条件。
• 如果可能的话，尽量确保工程变更协议同时由建设单位签字和盖章，以降低法律风险。
• 如果确实无法盖章，应确保签字人的身份和权限得到明确确认，并保留相关证据（如签字人的身份证明、授权委托书等）。
• 在实际履行过程中，密切关注对方对变更内容的反应和履行情况，以便及时采取措施应对可能的纠纷。

可能后果：

• 如果工程变更因形式要件不满足而被视为无效，可能导致双方按照原合同执行，从而引发额外的工程成本和工期延误。
• 如果因此发生纠纷并诉诸法律，可能面临诉讼成本、时间成本以及可能的败诉风险。

因此，在进行工程变更时，务必谨慎处理形式要件和生效条件的问题，以确保变更的有效性和双方的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。