在追诉时效内多次非法占用农用地，但每次均未达到刑事案件立案标准的情况下，面积一般不可以直接累计以达到刑事立案标准。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与解释
根据《最高人民法院关于审理破坏土地资源刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第9条的规定，“多次实施本解释规定的行为依法应当追诉的”，应理解为二次以上实施本解释规定的行为，且每次行为均构成犯罪，依法应当追诉的情形。这一规定明确了累计计算的前提是每次行为都达到刑事追诉标准。
二、不同情况下的处理
每次行为均未达到刑事追诉标准：
- 在此情况下，由于每次行为均未构成犯罪，因此不能简单地将面积进行累计以达到刑事立案标准。
部分行为达到刑事追诉标准：
- 如果行为人多次实施非法占用农用地行为，其中部分行为单次已达到刑事立案追诉标准，且未超过追诉时效，那么这些达到标准的面积可以相加，并依法进行追诉。
- 但对于未达到标准的部分，则不能直接累计。
先前行为已被行政处罚：
- 如果行为人先前的非法占用农用地行为已被行政处罚，但未完全履行处罚决定（如只缴纳罚款而未恢复原状），后续又非法占用农用地的，其前后占用的数量可以相加。
- 这是因为行为人未全部履行处罚决定，视为未处理完毕，且可以看出行为人的主观动机是通过蚕食手段达到大面积占用。
- 然而，如果行政处罚决定已全部履行完毕，恢复了农用地的植被和种植条件，则后续非法占用的数量不能累计。
三、法律建议
- 对于行为人：应严格遵守法律法规，避免非法占用农用地。如果确实需要占用，应依法办理相关手续，确保合法合规。
- 对于执法机关：在执法过程中，应准确理解并适用相关法律法规，确保执法的公正性和有效性。对于多次实施非法占用农用地行为但每次均未达到刑事追诉标准的情况，应依法进行行政处罚，并督促行为人履行处罚决定。
四、可能的法律后果
- 如果行为人多次非法占用农用地且每次均未达到刑事追诉标准，但累计后达到标准，而执法机关未依法进行追诉或处理不当，可能会引发社会不满和法律争议。
- 行为人如果继续实施非法占用农用地行为，可能会面临更严重的法律后果，包括刑事处罚和民事赔偿等。
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