擅自修改中小企业声明函，一般情况下都将被认定为提供虚假材料，但能够证明没有主观故意的除外。以下是对此问题的详细分析：

一、法律条款依据

根据《政府采购促进中小企业发展管理办法》第二十条的规定，供应商按照本办法规定提供声明函内容不实的，属于提供虚假材料谋取中标、成交，将依照《中华人民共和国政府采购法》等国家有关规定追究相应责任。这一条款明确指出了提供不实声明函的法律后果。

二、主观故意的认定

1. 故意修改：如果供应商或投标人故意修改中小企业声明函中的内容，如虚构营业收入、从业人员数量等，以谋取中标或成交，那么这种行为显然构成提供虚假材料。

2. 非故意修改：如果修改是由于疏忽、误解或错误导致的，且供应商或投标人能够提供充足的证据证明其没有主观故意，那么这种行为可能不被认定为提供虚假材料。但需要注意的是，实际操作中，主观故意和不小心误填是很难区分的，因此供应商或投标人需要承担较高的举证责任。

三、法律后果

1. 构成提供虚假材料：如果擅自修改中小企业声明函被认定为提供虚假材料，那么供应商或投标人将面临法律责任，包括但不限于被取消中标资格、罚款、列入不良行为记录名单等。

2. 不构成提供虚假材料：如果能够证明修改是由于非故意原因导致的，且没有造成严重后果，那么供应商或投标人可能不会受到法律制裁。但这种情况较为罕见，且需要充分的证据支持。

四、建议与措施

1. 谨慎填写：供应商或投标人在填写中小企业声明函时，应确保所填内容的真实性和准确性，避免因疏忽或误解而导致不必要的法律风险。

2. 保留证据：如果发现填写有误或需要修改，应及时与采购人或代理机构沟通，并保留相关证据以证明修改的非故意性。

3. 寻求法律帮助：如果面临法律纠纷或不确定如何填写声明函，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助和指导。

在实际操作中，供应商或投标人应严格遵守相关法律法规和规定，确保所提供的材料真实、准确、完整。如果有任何疑问或不确定之处，可以直接向我咨询，我会根据你具体情况提供专业的法律意见。