核心前提：用户询问的是未发包土地农民使用45年后应如何处理的问题，这涉及到土地使用权、土地承包经营权以及相关法律法规的适用。

结论前置：

1. 若土地性质未变且农民持续使用：

   • 根据《中华人民共和国农村土地承包法》及相关法律法规，若该土地在45年间一直由农民持续使用，且土地性质未发生变更（如未被征收、征用或转为其他用途），则农民可能已形成事实上的土地承包经营关系。
   • 在此情况下，农民有权要求确认其土地承包经营权，并可与土地所有权人（通常是村集体经济组织）协商签订正式的土地承包经营合同，明确双方的权利和义务。

2. 若土地性质发生变更或存在争议：

   • 若土地在45年间性质发生变更（如被征收、征用用于公共设施建设等），则农民的使用权可能受到影响，需根据相关法律法规和政策进行补偿或安置。
   • 若存在土地权属争议，如其他主体主张对该土地享有权利，则需通过法律途径解决争议，如提起土地权属确认之诉等。

3. 关于土地承包经营权的续期与调整：

   • 即便农民已形成事实上的土地承包经营关系，若土地承包经营期限已满或即将到期，农民需与土地所有权人协商续期事宜。
   • 在续期过程中，双方可根据实际情况对土地承包经营合同的内容进行调整，如承包期限、承包费用、土地用途等。

详细分析：

• 土地使用权与承包经营权：农民对未发包土地的使用，若持续且未受干扰，可能形成事实上的土地承包经营权。这种权利虽非基于正式合同产生，但受法律保护，农民有权要求确认并签订正式合同。

• 土地性质变更的影响：土地性质变更（如征收、征用）将直接影响农民的使用权。在此情况下，农民需关注相关法律法规和政策，确保自身权益得到妥善补偿或安置。

• 土地权属争议的解决：若存在土地权属争议，农民应积极收集证据，通过法律途径维护自身权益。在争议解决过程中，农民可寻求专业法律帮助，以确保争议得到公正、合理的处理。

• 土地承包经营权的续期与调整：土地承包经营期限的续期与调整是农民需关注的重要问题。在续期过程中，农民应与土地所有权人充分沟通，确保合同内容符合双方利益，并保障农民的合法权益。

综上所述，未发包土地农民使用45年后应如何处理，需根据土地性质、使用情况、权属争议等因素进行综合判断。农民在处理此类问题时，应积极了解相关法律法规和政策，必要时可向我咨询，以确保自身权益得到妥善保护。