核心结论：

1. 关于保险公司垫付的五千元：

   • 保险公司垫付的五千元，通常是在事故发生后，为了及时救治伤者而进行的先行支付。这笔款项的性质和用途，主要取决于保险合同中的约定以及事故处理的具体情况。

2. 关于出院后赔付费用的处理：

   • 出院后的赔付费用，是根据伤者的实际损失、保险合同的约定以及相关法律法规来确定的。保险公司会根据这些因素，对伤者进行最终的赔付。

3. 关于垫付款项是否会被扣走：

   • 保险公司垫付的五千元，是否会在出院后的赔付中被扣走，这主要取决于保险合同中的具体条款以及事故处理的流程。
   • 如果保险合同中明确规定了垫付款项的处理方式，比如作为最终赔付的一部分或者需要单独结算，那么就应当按照合同约定来执行。
   • 如果合同中没有明确规定，或者规定不够清晰，那么就需要根据事故处理的具体情况、相关法律法规以及保险公司的理赔政策来综合判断。

详细分析：

• 保险合同约定：首先，要仔细查看保险合同中的相关条款，了解保险公司对于垫付款项的处理方式。有些合同可能会明确规定垫付款项作为最终赔付的一部分，而有些合同则可能要求单独结算。

• 事故处理流程：其次，要了解事故处理的具体流程。在事故处理过程中，保险公司可能会根据伤者的治疗情况、医疗费用支出等因素，对垫付款项进行动态调整。如果最终确定的赔付金额大于垫付款项，那么保险公司可能会补足差额；如果最终确定的赔付金额小于垫付款项，那么保险公司可能会要求返还多余部分。

• 法律法规：此外，还要考虑相关法律法规的规定。在某些情况下，法律法规可能会对保险公司的垫付行为和赔付责任做出明确规定，这些规定也会影响到垫付款项的处理方式。

建议：

• 如果您对保险合同中的条款或者事故处理流程有疑问，建议您及时与保险公司沟通，了解他们的具体政策和操作流程。
• 如果您认为保险公司的处理方式存在不合理之处，或者您对赔付金额有异议，那么您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。在这种情况下，您可以向我咨询相关的法律问题，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。