第三方清标价格能否作为结算依据，主要取决于合同双方的约定以及清标过程的合规性。具体分析如下：

一. 工程价款结算依据的一般原则

1. 合同约定优先：根据《建设工程价款结算暂行办法》（财建〔2004〕369号）第十一条，以及《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释(一)》（法释〔2020〕25号）第十九条第1款，工程价款的结算依据一般应按当事人双方合同约定办理。

二. 第三方清标价格的性质与效力

1. 性质：第三方清标通常被视为一种由独立第三方机构对工程项目进行的造价审核行为，旨在提供客观、公正的造价信息。
2. 效力：第三方清标价格能否作为结算依据，关键在于合同双方是否明确约定以清标价格为结算依据，以及清标过程是否遵循了相关法律法规和行业标准。

三. 具体情形分析

1. 合同有明确约定：如果建设工程施工合同中明确约定以第三方清标价格作为结算依据，且清标过程合规，那么第三方清标价格应当作为结算依据。
2. 合同无明确约定：如果合同中没有明确约定以第三方清标价格作为结算依据，或者清标过程存在不合规情况，那么第三方清标价格就不能直接作为结算依据。此时，双方应依据合同约定的其他结算条款或者相关法律法规进行协商处理。

四. 法律风险防范建议

为确保第三方清标价格能够作为有效的结算依据，建议在合同签订和清标过程中注意以下几点：

1. 明确约定：在合同中明确约定以第三方清标价格作为结算依据，并明确清标机构的选择、清标程序、清标结果的认可方式等。
2. 合规操作：确保清标过程遵循相关法律法规和行业标准，确保清标结果的客观性和公正性。
3. 及时沟通：在清标过程中，双方应保持及时沟通，对清标结果有异议的应及时提出并协商解决。

我建议，在实际操作中，应根据具体情况判断第三方清标价格能否作为结算依据，并采取相应的法律风险防范措施。如有进一步需要，您可以继续咨询我。