针对您提出的手写结婚证系统查不到是否可以写解除同居关系协议的问题，以下是我的详细解答：

1. 关于手写结婚证系统查不到的情况：

   • 首先，需要明确的是，结婚证是婚姻关系成立的法定证明文件。如果您的结婚证是手写的，并且在婚姻登记系统中查不到相关信息，这可能是由于历史原因、登记系统更新不及时或登记信息录入错误等多种因素导致的。
   • 在这种情况下，建议您先到当地的婚姻登记机关进行查询和核实，了解结婚证的具体情况。如果确认结婚证是真实有效的，但系统查不到，可以要求婚姻登记机关出具相关证明或进行信息补录。

2. 关于解除同居关系协议：

   • 解除同居关系协议通常适用于未办理结婚登记而以夫妻名义共同生活的情侣。如果双方确实没有办理结婚登记，且现在希望解除同居关系，那么可以签订解除同居关系协议。
   • 然而，如果双方实际上已经办理了结婚登记（即使结婚证是手写的且系统查不到），那么他们之间就是合法的夫妻关系，此时应该通过离婚程序来解除婚姻关系，而不是签订解除同居关系协议。
   • 签订解除同居关系协议时，双方应明确协议的内容，包括但不限于财产分割、子女抚养、债务承担等事项，并确保协议内容合法、有效、不违反公序良俗。

3. 法律建议：

   • 在处理此类问题时，建议您先咨询专业的律师或法律机构，了解您的具体情况和法律权益。
   • 如果确认双方是合法的夫妻关系，但结婚证系统查不到，应尽快到婚姻登记机关进行核实和补录信息，以便后续通过离婚程序来解除婚姻关系。
   • 如果双方确实没有办理结婚登记，且现在希望解除同居关系，那么可以签订解除同居关系协议，并确保协议内容合法、有效。

4. 可能的法律后果：

   • 如果双方是合法的夫妻关系，但错误地签订了解除同居关系协议，该协议可能因违反法律规定而无效。
   • 如果双方没有办理结婚登记而签订了解除同居关系协议，但协议内容违反了法律规定或公序良俗，也可能导致协议无效或部分无效。

综上所述，手写结婚证系统查不到并不直接决定是否可以写解除同居关系协议。关键在于双方是否已经办理了结婚登记。如果已经办理了结婚登记，应通过离婚程序来解除婚姻关系；如果没有办理结婚登记，则可以签订解除同居关系协议。在处理此类问题时，建议您咨询专业的律师或法律机构以确保您的权益得到保障。如果您有任何法律问题，可以直接向我咨询。