工伤认定科确实可以对有争议的工伤进行认定。以下是对这一问题的详细解答：

1. 工伤认定科的职责：

   • 工伤认定科是负责处理工伤认定申请的专门机构，其职责包括接收、审查工伤认定申请，进行必要的调查核实，并最终作出工伤认定决定。
   • 在处理工伤认定申请时，工伤认定科会依据相关法律法规和事实情况，对工伤事故进行客观、公正的认定。

2. 有争议工伤的认定：

   • 当工伤认定申请存在争议时，工伤认定科并不会因此回避或拒绝认定。相反，它会更加谨慎地审查申请材料，进行深入的调查核实，以确保认定结果的准确性和公正性。
   • 在认定过程中，工伤认定科可能会要求申请人提供更多的证据材料，或者进行现场勘查、询问证人等，以全面了解工伤事故的情况。

3. 认定结果的法律效力：

   • 工伤认定科作出的工伤认定决定具有法律效力，是后续工伤赔偿、康复治疗等事项的重要依据。
   • 如果申请人或用人单位对工伤认定决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，但在此之前，工伤认定决定仍然有效。

4. 法律建议：

   • 对于有争议的工伤认定申请，建议申请人或用人单位积极配合工伤认定科的调查核实工作，提供真实、完整的证据材料。
   • 如果对工伤认定决定不服，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并依法采取相应的法律措施。

综上所述，工伤认定科可以对有争议的工伤进行认定，并会依据相关法律法规和事实情况作出客观、公正的认定决定。如果您在工伤认定方面遇到任何问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。