自建房继承父母协议的有效性，主要取决于以下几个关键因素：
协议签订的自愿性：
- 协议必须是由所有继承人自愿签订的，不能存在欺诈、胁迫等情形。如果协议是在被强迫或欺骗的情况下签署的，那么它可能不具有法律效力。
协议内容的合法性：
- 协议内容必须符合法律法规的规定，不能违反法律或行政法规的禁止性规定。例如，协议不能剥夺特定法定继承人的继承权，也不能违反关于财产处分的法律规定。
协议形式的合规性：
- 虽然法律并未明确规定继承协议必须采用书面形式，但为了确保协议的有效性和可执行性，建议采用书面形式，并由所有继承人签字确认。这样可以在发生争议时提供明确的证据。
协议是否经过公证：
- 如果协议经过了公证，那么它的效力会更有保障。公证可以增加协议的公信力，减少后续争议的可能性。
考虑遗嘱的影响：
- 如果父母在生前立有遗嘱，并且遗嘱中关于自建房的继承安排与协议内容不一致，那么需要综合考虑遗嘱和协议的效力。一般来说，遗嘱是立遗嘱人真实意思的表示，具有较高的法律效力。但如果遗嘱存在形式或内容上的瑕疵，或者与协议内容存在冲突，那么可能需要通过法律程序来解决争议。
具体分析：
- 如果自建房继承父母协议满足上述所有条件，即自愿签订、内容合法、形式合规，并且可能经过了公证，同时没有与遗嘱产生冲突，那么该协议通常是有效的。
- 如果协议存在欺诈、胁迫等情形，或者内容违反法律法规的规定，或者形式不符合要求，或者与遗嘱产生冲突且无法解决，那么该协议可能是无效的。
法律建议：
- 在签订自建房继承父母协议之前，建议所有继承人充分了解协议的内容和法律效力，确保协议是自愿签订的，并且内容合法合规。
- 如果可能的话，建议对协议进行公证，以增加其公信力和可执行性。
- 如果在继承过程中遇到争议或问题，建议及时咨询专业律师，以便通过法律程序来解决争议并保护自己的合法权益。
总之，自建房继承父母协议的有效性是一个复杂的问题，需要综合考虑多个因素。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。