针对您提出的“教师被判有期徒刑三年，教师资格怎样处理”这一问题，以下是我的详细解答：

首先，根据《中华人民共和国教师法》第十四条的明确规定，任何受到剥夺政治权利或者因故意犯罪受到有期徒刑以上刑事处罚的个人，均不能取得教师资格；若已取得教师资格，则将丧失该资格。这一法律条款为教师的职业行为设定了严格的道德和法律底线，确保了教师队伍的纯洁性和专业性。

在您提到的案例中，该教师因故意犯罪被判处三年有期徒刑，这一事实直接触发了《教师法》第十四条关于丧失教师资格的规定。因此，该教师的教师资格将依法自动丧失。按照相关程序，教育部门应依法办理其教师资格注销手续，并收缴其教师资格证书，以确保其不再具备从事教育教学工作的法律资格。

进一步地，除了丧失教师资格外，该教师还将面临被学校开除的严厉处分。根据《教师法》的相关规定及教育行业的特殊性，教师进行故意犯罪并被人民法院判处有罪后，不仅将丧失教师资格，还将受到行政处分，甚至可能被解雇。这一规定体现了对教师职业道德和操守的高标准、严要求，旨在维护教育行业的纯洁性和社会公信力。

此外，该教师还可能面临一系列间接后果，如社会声誉受损、失业、经济损失以及家庭关系破裂等。这些后果将对其个人生活和工作产生深远影响。

综上所述，对于因故意犯罪被判三年有期徒刑的教师而言，其不仅已经丧失了教师资格，且无法再重新获得，同时还将面临被学校开除的严重后果。这一处理结果既符合法律法规的明确规定，也彰显了教育行业对师德师风建设的重视和决心。希望这一解答能够对您有所帮助。