针对您提出的“虚开增值税专用发票罪价税合计200万元，公安局立案后补缴了税款是否还会处罚”的问题，以下是我的详细解答：

首先，虚开增值税专用发票是一种严重的违法行为，它破坏了税收征管秩序，损害了国家利益。根据相关法律法规，虚开增值税专用发票，虚开税额达到一定标准（如50万元以上），即构成犯罪，且属于加重情节。在您提到的案例中，价税合计200万元，显然已经超出了这一标准，因此行为人的行为已经构成了虚开增值税专用发票罪。

其次，关于补缴税款的问题，补缴税款是行为人在意识到自己的违法行为后，采取的一种事后挽回损失的行为。这种行为虽然可以在一定程度上减轻犯罪的危害后果，但并不影响犯罪的构成。也就是说，即使行为人补缴了税款，也不能免除其因虚开增值税专用发票而应承担的刑事责任。

在司法实践中，法院在量刑时会综合考虑各种因素，包括犯罪的性质、情节、社会危害程度以及行为人的认罪态度、补缴税款情况等。补缴税款可以作为从轻或减轻处罚的一个情节，但并不能成为免除刑罚的理由。因此，即使行为人补缴了税款，司法机关仍会依法追究其刑事责任。

综上所述，对于虚开增值税专用发票罪价税合计200万元的情况，即使公安局立案后行为人补缴了税款，司法机关仍会依法追究其刑事责任。补缴税款虽然可以在一定程度上减轻处罚，但并不能免除刑罚。希望这个解答能够对您有所帮助。