部门经理扣员工工资是否合法，需视具体情况而定。以下是从不同角度的分析：

1. 公司有明确规章制度且合法合规：

   • 如果公司有明确的规章制度，规定了扣工资的情形及标准，且该规定符合法律法规及公序良俗，同时部门经理扣工资的行为是依据此规定进行的，那么这种扣工资行为通常是合法的。
   • 例如，员工因违反公司规定或未完成工作任务，按照公司规章制度被扣除一定比例的工资，且扣除后工资不低于当地最低工资标准，这样的扣工资行为就是合法的。

2. 公司无相关规定或扣工资行为超出合理范围：

   • 如果公司没有相关规定，或者部门经理扣工资的行为超出了合理范围，例如无故克扣、恶意扣除等，那么这种行为就可能是不合法的。
   • 例如，部门经理因个人喜好或偏见，随意扣除员工工资，且扣除金额无合理依据，这样的扣工资行为就是不合法的。员工有权要求公司返还被克扣的工资，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

3. 扣工资金额的限制：

   • 根据《劳动法》等相关法规，即使员工有过失行为，如导致公司经济损失，将按照合理制定的规则实行工资扣除，但是所扣除金额的比例不能超过当月工资的20%，且扣除后仍需保证支付的工资不低于当地最低工资标准。
   • 如果部门经理扣工资的金额超过了这一限制，那么这种扣工资行为也是不合法的。

法律建议：

• 如果您认为部门经理扣工资的行为不合法，首先可以与公司的人力资源部门或上级领导进行沟通，了解扣工资的具体原因和依据。
• 如果沟通无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

可能的法律后果：

• 如果部门经理扣工资的行为被认定为不合法，公司可能需要返还被克扣的工资，并可能面临劳动监察部门的处罚。
• 如果因扣工资行为导致员工离职或产生其他劳动纠纷，公司还可能需要承担相应的法律责任和经济赔偿。

总之，判断部门经理扣工资是否合法，关键在于是否有合法依据以及行为是否合理。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。