当遇到业主违章搭建的情况时，物业公司可以按照以下步骤和方式进行妥善处理：

一、及时劝阻与沟通

物业公司一旦发现业主有违章搭建行为，应立即采取行动，上门与业主进行友好沟通。在沟通中，要明确向业主说明违章搭建的危害性，比如可能影响小区的整体规划、侵犯其他业主的合法权益、存在安全隐患等。同时，要求业主自行停止搭建行为，并拆除已经搭建的部分。这一步是处理违章搭建问题的首要环节，也是最为温和且有效的方式。

二、发出书面整改通知

如果劝阻无效，物业公司应以书面形式向业主发出整改通知。在通知中，要明确告知业主其行为违反了哪些相关规定，并要求业主在限定时间内完成整改。同时，为了增强整改通知的权威性和执行力，物业公司可以将整改通知的副本抄送给相关的行政管理部门，如城市规划、建设、城管等。

三、报告相关部门并配合查处

若业主在规定期限内仍未进行整改，物业公司应及时向上述提到的相关行政管理部门报告。这些部门将依法对违章搭建行为进行查处。在此过程中，物业公司应积极配合相关部门的工作，提供必要的证据和信息，如违章搭建的照片、视频、业主的联系方式等，以便相关部门能够迅速、准确地了解情况并作出处理。

四、后续跟进与巡查

在相关部门处理后，物业公司要关注处理结果，确保违章搭建问题得到妥善解决。同时，为了防止类似问题再次发生，物业公司应加强对小区的日常巡查，及时发现并制止新的违章搭建行为。

此外，从更广泛的角度来看，处理业主违章搭建问题还需要整个小区的共同努力和配合。业主委员会可以发挥监督作用，督促违章搭建的业主改正行为；其他业主也可以积极向物业或相关部门反映情况，共同维护小区的秩序和美观。

综上所述，物业公司处理业主违章搭建问题需要采取一系列措施，包括及时劝阻与沟通、发出书面整改通知、报告相关部门并配合查处以及后续跟进与巡查等。通过这些措施的实施，可以有效地维护小区的秩序和其他业主的合法权益。