出租车违规收费一般由交通运输管理部门或道路运输管理机构中的相关执法部门进行处罚，但具体股室可能因地区、机构设置的不同而有所差异。

在多数情况下，出租车违规收费会由负责客运管理、运价管理或市场监督的股室进行处理。这些股室通常负责监督出租车的运营行为，包括是否按照规定的运价收费，是否提供了符合标准的服务等。

为了更准确地了解具体负责处罚的股室，我建议你直接咨询当地的交通运输管理部门或道路运输管理机构，他们可以根据你的具体情况给出明确的答复。同时，如果你遇到了出租车违规收费的情况，也可以直接向这些部门投诉，他们会依法进行调查和处理。