可以提出异议。针对建设工程合同中约定以第三方造价审核的金额为准的条款，提出异议的合法性和合理性主要基于以下几点分析：

1. 合同约定的灵活性：

   • 建设工程合同作为一种特殊的合同类型，其条款应当具备一定的灵活性以适应实际施工过程中的各种变化。
   • 如果合同中的某些条款（如以第三方造价审核的金额为准）在实际执行中出现了显著的不公平或不合理，当事人有权基于合同法的公平原则提出异议。

2. 第三方造价审核的局限性：

   • 第三方造价审核虽然具有一定的客观性和公正性，但其结果也可能受到多种因素的影响，如审核标准、审核人员的专业水平、审核过程中的信息不对称等。
   • 因此，如果当事人有充分理由认为第三方造价审核的结果不准确或不合理，可以提出异议并要求重新审核或协商确定造价。

3. 合同法的相关规定：

   • 根据合同法的相关规定，当事人在签订合同时应当遵循公平、诚实信用等原则。
   • 如果合同中的某些条款违反了这些原则，或者在实际执行中导致了显著的不公平，当事人有权请求人民法院或仲裁机构变更或撤销该条款。

4. 提出异议的程序和注意事项：

   • 当事人在提出异议时，应当首先明确异议的具体内容和理由，并提供相关证据支持其异议。
   • 异议应当以书面形式提出，并尽量在合同约定的异议期限内提出，以避免因超过期限而丧失异议权。
   • 如果合同没有约定异议期限，当事人应当在知道或应当知道异议事由之日起合理期限内提出异议。

综上所述，建设工程合同中约定以第三方造价审核的金额为准的条款并非不可异议。在实际执行过程中，如果当事人有充分理由认为该条款存在不公平或不合理之处，可以依法提出异议并要求重新协商或确定造价。