您好，针对您提出的“单独签试用期三个月是否合法”的问题，我进行了详细的查阅和分析，以下是给您的解答：

首先，我们需要明确的是，试用期的约定是与劳动合同期限直接相关的。根据《劳动合同法》第十九条的规定，劳动合同期限与试用期的对应关系如下：

1. 劳动合同期限三个月以上不满一年的，试用期不得超过一个月；
2. 劳动合同期限一年以上不满三年的，试用期不得超过二个月；
3. 三年以上固定期限和无固定期限的劳动合同，试用期不得超过六个月。

从您提供的信息来看，如果单独签订一个三个月的试用期合同，而没有明确的主劳动合同期限，这是不符合《劳动合同法》的规定的。因为试用期的存在是为了在劳动合同期限内，给双方一个相互了解、协商和适应的过程，它不能脱离劳动合同而单独存在。

此外，《劳动合同法》还规定，同一用人单位与同一劳动者只能约定一次试用期。这意味着，如果试用期结束后，双方决定继续履行劳动合同，那么就不能再次约定试用期。

综上所述，单独签试用期三个月是不合法的。试用期必须是在劳动合同期限内约定的，并且需要符合上述的期限规定。如果用人单位有此类行为，劳动者可以向劳动监察部门投诉，维护自己的合法权益。

希望这个解答能够对您有所帮助，如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。