两个单位联合行文时，签发人不可以只用主办机关签发人。以下是详细解释：
联合行文的原则：联合行文是指两个或两个以上的机关、部门或单位共同制发公文的行为。在联合行文中，各参与方都应承担相应的责任和义务，因此，公文的签发也应当体现这一原则。
签发人的设置：根据《党政机关公文处理工作条例》等相关规定，联合行文时，一般应当由各联署机关的负责人共同签发公文。这意味着，每个参与联合行文的单位都应有其负责人作为签发人，以确保公文的合法性和有效性。
主办机关的角色：虽然主办机关在联合行文中可能承担主要责任，负责协调各方、起草公文等，但这并不意味着可以省略其他联署机关的签发人。主办机关的签发人只是代表其本单位对公文内容进行确认和签发，而不能代替其他单位。
实践中的操作：在实际工作中，联合行文时通常会明确列出所有参与单位的签发人姓名，并按照一定的顺序排列。这样做既符合公文处理的规定，也能确保公文的权威性和可执行性。
综上所述，两个单位联合行文时，签发人不能只用主办机关的签发人，而应按照相关规定，由各联署机关的负责人共同签发。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。