您好，针对劳动合同中存在两种笔迹的情况，处理起来需要细致分析并遵循相关法律法规。以下是一些具体的建议来帮助您处理这一问题：
一、明确笔迹形成原因
首先，要弄清楚两种笔迹的形成原因。这可能是因为合同在签订过程中进行了修改、补充，或者由不同人填写了不同部分。了解笔迹形成的原因对于后续的处理至关重要。
二、核实合同内容真实性
双方确认：如果两种笔迹的形成是双方共同认可的结果，比如一方在合同签订后对某些条款进行了手写修改，并且双方都签字确认了这些修改，那么这份合同通常是有效的。
司法鉴定：如果双方对笔迹的真实性存在争议，或者无法确定笔迹的形成原因，可以考虑通过司法鉴定等方式来验证笔迹的真实性和合法性。这通常涉及专业的笔迹鉴定机构或专家，他们能够提供权威的鉴定结果。
三、评估合同效力
在核实了笔迹的真实性和合法性后，需要评估合同的效力。这主要取决于以下几个方面：
合同内容是否合法：合同内容必须遵守国家法律法规，不得违反强制性规定。如果合同内容违法，那么无论笔迹如何，合同都是无效的。
双方意思表示是否真实：合同的签订必须是双方真实意思的表示。如果一方在签订合同时存在欺诈、胁迫等情形，那么合同可能被视为无效或部分无效。
合同形式是否符合要求：对于某些特定类型的合同（如劳动合同），法律可能对其形式有特定要求（如书面形式）。如果合同形式不符合法律规定，那么合同可能被视为无效。
四、处理建议
沟通协商：如果双方对合同内容没有异议，只是笔迹问题，可以尝试通过沟通协商来解决。双方可以共同确认合同内容，并签署一份补充协议来明确双方的权利和义务。
法律途径：如果双方无法达成一致，或者合同内容存在争议，建议寻求法律途径来解决。可以咨询专业律师或法律机构，通过法律程序来维护自己的合法权益。
综上所述，处理劳动合同中两种笔迹的问题需要综合考虑多个方面，包括笔迹形成原因、合同内容真实性、合同效力以及双方意愿等。建议根据实际情况采取合适的措施来处理这一问题。