企业职工查乙肝是否属于违规，需根据具体情况分析。以下是对此问题的详细解答：
一般情况下的乙肝检查：
- 根据相关法律法规，如《关于维护乙肝表面抗原携带者就业权利的意见》和《关于进一步规范入学和就业体检项目维护乙肝表面抗原携带者入学和就业权利的通知》，用人单位在招、用工过程中，不得强行将乙肝病毒血清学指标作为体检标准，除非特定行业有法律法规要求。
- 因此，在普通入职体检或职业健康检查中，公司未经员工同意擅自检查乙肝相关项目，可能侵犯员工的隐私权，构成违规。
特殊职业情况下的乙肝检查：
- 对于某些特定职业，如食品生产经营、饮用水生产供应、公共场所服务、托幼机构保育等，由于这些职业直接涉及公共卫生安全，相关法律法规可能要求员工进行乙肝项目检测。
- 在这些情况下，公司要求检查乙肝项目是符合规定的，但仍需确保检查过程的合法性、公正性，并严格保密检查结果，以保护员工的个人隐私权。
总结与建议：
- 公司在进行乙肝检查时，必须严格遵守相关法律法规，充分考虑员工的权益和隐私保护。
- 对于一般情况下的乙肝检查，应避免擅自进行；对于特定职业要求的乙肝检查，应确保检查过程的合法、公正与保密。
- 如员工认为公司违规进行了乙肝检查并侵犯了自己的权益，可以与公司协商解决，或向劳动监察部门投诉，甚至提起法律诉讼，要求公司承担相应的法律责任。
希望以上解答能对您有所帮助。如有其他法律问题，欢迎随时向我咨询。