乡镇政府合法直接强制拆除违章建筑的费用，通常由违法建设者承担。以下是对此结论的详细解释：

法律依据

1. 《汕头经济特区城乡规划条例》第一百零四条：城乡规划主管部门作出责令限期拆除并清理现场的决定后，建设单位或者个人逾期不拆除并清理现场的，由本级人民政府责成的部门依法强制拆除并清理现场，强制拆除和清理现场的费用由违法行为人承担。
2. 《行政强制法》相关规定：也体现了对违法行为的制裁原则，即违法者应承担相应的法律后果，包括强制拆除费用。

理由分析

1. 违法建设行为的性质：违章建筑违反了法律法规，侵占了公共资源，损害了社会公平和公共利益。因此，违法建设者应当承担由此产生的法律后果，包括强制拆除的费用。
2. 法律制裁原则：法律对于违法行为通常会设定相应的制裁措施，以维护社会秩序和公共利益。强制拆除违章建筑并要求违法建设者承担费用，是对违法行为的制裁和惩戒。
3. 公平原则：如果允许违法建设者逃避强制拆除费用的承担，将是对其他守法者的不公平。因此，要求违法建设者承担强制拆除费用，体现了法律的公平原则。

特殊情况说明

虽然通常情况下违法建设者需要承担强制拆除费用，但在某些特殊情况下，如政府存在过错或违法行为导致建筑被误判为违章建筑并强制拆除，那么政府可能需要承担相应的责任。然而，这需要根据具体案件的事实和证据来判断。

综上所述，乡镇政府合法直接强制拆除违章建筑的费用，通常由违法建设者承担。这是基于法律制裁原则、公平原则以及违法建设行为的性质所得出的结论。如果在实际操作中遇到相关问题，建议咨询专业律师以获取更具体的法律意见和帮助。