当股东对公司的全资子公司主张知情权时，被告应当是全资子公司。以下是具体的分析：

法律依据

根据《公司法》的相关规定，股东有权查阅、复制公司章程、股东会会议记录、董事会会议决议、监事会会议决议和财务会计报告等公司重要文件，这是股东知情权的重要体现。当股东对公司的全资子公司提出知情权主张时，实际上是要求全资子公司提供这些法定文件以供查阅、复制。

逻辑分析

1. 股东与公司的关系：股东是公司的出资人，享有公司法规定的各项权利，包括知情权。全资子公司作为公司的下属单位，其管理和运营均受母公司控制，但法律上仍是独立的法人实体。

2. 知情权的行使对象：股东知情权是针对公司而言的，即股东有权要求公司提供相关文件和信息。在全资子公司的情况下，股东虽然通过母公司间接控制全资子公司，但直接行使知情权时，仍应以全资子公司为对象。

3. 被告的确定：在股东提起知情权诉讼时，其诉求是要求公司提供特定文件以供查阅、复制。因此，在诉讼中，被告应当是负有提供这些文件义务的主体，即全资子公司。

实际操作建议

1. 明确诉求：股东在提起知情权诉讼前，应明确自己的诉求，即要求全资子公司提供哪些具体文件和信息。

2. 收集证据：股东应收集证明自己股东身份以及全资子公司未履行提供文件义务的证据，如股东名册、出资证明、请求提供文件的书面记录等。

3. 提起诉讼：在准备好相关证据后，股东可以向有管辖权的人民法院提起诉讼，要求全资子公司履行提供文件的义务。

综上所述，当股东对公司的全资子公司主张知情权时，被告应当是全资子公司。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。