阻碍有关部门反恐工作的处罚是：由公安机关对单位处二十万元以下罚款，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员处五日以上十五日以下拘留，可以并处五万元以下罚款。

这一处罚规定来源于《中华人民共和国反恐怖主义法》。具体来说，该法规定任何单位都有协助、配合有关部门开展反恐怖主义工作的义务。如果单位阻碍有关部门开展反恐怖主义工作，就会受到上述的处罚。

在实际操作中，如果某个单位被认定阻碍了反恐工作，公安机关会依法对其进行处罚。处罚的具体程度会根据阻碍的严重程度、造成的后果以及单位的具体行为等因素来确定。同时，对于直接负责的主管人员和其他直接责任人员，也会依法给予相应的拘留和罚款处罚。

因此，建议各单位务必遵守相关法律法规，积极协助、配合有关部门开展反恐怖主义工作，以确保社会的安全和稳定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。