针对您提出的问题，“合法的房屋被非法强拆和违法的房屋被非法强拆法院判决会一样吗”，我的回答如下：

结论前置：合法的房屋被非法强拆与违法的房屋被非法强拆，在法院判决上可能会存在显著差异。

分析说明：

1. 合法房屋被非法强拆：

   • 法律依据：合法房屋受到法律保护，任何单位或个人不得非法拆除。若发生非法强拆，被拆迁人有权依法要求赔偿。
   • 法院判决倾向：法院通常会认定非法强拆行为违法，并判决相关责任方承担赔偿责任，包括房屋价值、搬迁费用、临时安置费用以及可能的精神损害赔偿等。

2. 违法房屋被非法强拆：

   • 法律依据：违法建筑本身不受法律保护，但拆除行为仍需依法进行。即使房屋是违法的，也不能随意拆除，必须按照法定程序进行。
   • 法院判决倾向：
     • 若拆除行为本身违法（如未履行法定程序、未给予适当补偿等），法院可能会认定拆除行为违法，并判决相关责任方承担一定的赔偿责任，但赔偿范围可能仅限于与拆除行为直接相关的损失。
     • 若拆除行为合法或仅存在轻微瑕疵，且违法建筑本身不受法律保护，法院可能会驳回被拆迁人的赔偿请求。

总结：

合法的房屋被非法强拆时，法院通常会严格保护被拆迁人的合法权益，并判决相关责任方承担全面的赔偿责任。而违法的房屋被非法强拆时，虽然拆除行为本身可能违法并需承担一定责任，但由于房屋本身的违法性，赔偿范围和判决结果可能会受到一定影响。

因此，在处理这类问题时，需要综合考虑房屋的性质、拆除行为的合法性以及相关法律法规的规定，以作出准确的判断。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。