被害人不能确定死因，一般不能定案。以下是详细分析：

一. 被害人死亡原因不具有确定性时，不能作为定案依据

• 在刑事案件中，被害人的死因是确定犯罪嫌疑人是否构成犯罪以及构成何种犯罪的关键证据之一。如果被害人的死因无法确定，那么就无法准确判断犯罪嫌疑人的行为与被害人的死亡之间是否存在因果关系。
• 例如，在聂树斌案中，最高人民检察院指出，原审判决所采信的尸体检验报告证明力不足，尸体检验仅是对头皮剥离，而没有对尸体全面进行解剖，就认定“全身未发现明显创口及骨折”缺乏依据。因此，单纯依靠这样的间接证据不能证实被害人死亡与聂树斌有关。

二. 法律依据

• 根据《刑事诉讼法》的相关规定，证据确实、充分是定罪量刑的基本要求。证据必须经过查证属实，才能作为定案的根据。如果被害人的死因无法确定，那么相关的证据就存在重大疑问，无法满足证据确实、充分的要求。

三. 实际案例

• 聂树斌案就是一个典型的例子。由于被害人的死因无法明确，加之其他证据存在重大瑕疵，最高人民检察院最终认为原审判决认定事实不清，证据不足，依据现有证据不能认定聂树斌实施了故意杀人、强奸妇女的行为。

综上所述，在被害人不能确定死因的情况下，一般不能定案。因为死因是判断犯罪嫌疑人与被害人死亡之间是否存在因果关系的关键证据，如果死因无法确定，那么相关的证据链就无法完整闭合，无法满足定罪量刑的基本要求。我的观点是，在这种情况下，应当遵循疑罪从无的原则，依法宣告被告人无罪。如有进一步需要，您可以继续咨询我。