关于“企业询证函甲方是否有义务配合”的问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

结论前置

企业询证函是企业在财产清查中为了核实往来款项的真实性而寄送往来单位的一种核对函件，本质上属于企业间的正常商业行为。虽然法律没有明确规定甲方必须配合回复询证函，但从商业惯例和诚信原则出发，甲方通常应当予以配合。

详细分析

1. 询证函的性质与目的：

   • 询证函是企业间核对债权债务情况的一种常用方式，旨在确认特定日期的债权债务余额。
   • 它不是法律诉讼的直接证据，但可以作为辅助证据或间接证据在诉讼中使用。

2. 甲方的配合义务：

   • 商业惯例：在商业实践中，收到询证函的一方通常会予以配合，盖章确认并返回，以维护良好的商业关系。
   • 诚信原则：配合询证函的回复体现了企业的诚信和负责任态度，有助于建立和维护商业信誉。
   • 合同义务：如果双方之前有明确约定或合同条款要求配合询证函的回复，那么甲方就有合同上的义务予以配合。

3. 不配合的可能后果：

   • 商业关系受损：不配合询证函的回复可能会损害与发出方的商业关系，影响未来的合作。
   • 法律诉讼风险：在某些情况下，如果甲方拒绝配合询证函的回复，而该询证函的内容又涉及法律纠纷，那么甲方可能会面临法律诉讼的风险。

4. 特殊情况下的处理：

   • 如果甲方对询证函的内容有异议或认为回复可能涉及法律风险，可以及时与发出方沟通，说明情况并寻求解决方案。
   • 在某些特殊情况下，如涉及商业秘密或敏感信息，甲方可以谨慎考虑是否回复询证函，并咨询专业律师的意见。

综上所述，虽然法律没有明确规定甲方必须配合回复企业询证函，但从商业惯例、诚信原则以及维护良好商业关系的角度出发，甲方通常应当予以配合。如果甲方对询证函的内容有异议或担忧，可以及时与发出方沟通并寻求专业法律意见。