二审判决书中明确写了“如有新证据可以另案起诉”，这样的表述并不违反法律规定，也不当然无效。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律原则与规定：

   • 在诉讼程序中，通常遵循“一事不再理”的原则，即对于同一当事人、同一法律关系、同一诉讼请求的案件，法院一般不再受理。但这一原则并非绝对，存在例外情况。
   • 当有新证据出现时，如果这些新证据能够证明原诉讼中未涉及的事实或权益，或者与原诉讼的法律关系或诉讼请求不同，那么当事人是有可能另行起诉的。

2. 二审判决书表述的理解：

   • 二审判决书中明确写了“如有新证据可以另案起诉”，这实际上是在告知当事人，如果他们在未来发现了新的证据，并且这些证据符合法定条件，那么他们有权利另行提起诉讼。
   • 这样的表述并不违反“一事不再理”的原则，因为它设定了条件，即“如有新证据”。这意味着，只有当新证据出现时，当事人才可以另行起诉。

3. 实践中的应用：

   • 在实际诉讼中，当事人如果发现新证据，并且认为这些证据足以支持他们另行起诉，那么他们可以向有管辖权的法院提交起诉状和新证据。
   • 法院会审查这些新证据，以及它们是否满足另行起诉的条件。如果法院认为新证据确实足以支持另行起诉，并且符合其他法定条件，那么法院会受理该案件。

综上所述，二审判决书中明确写了“如有新证据可以另案起诉”的表述并不违反法律规定，也不当然无效。当事人在发现新证据后，有权根据法律规定和实际情况另行提起诉讼。如果你对此有进一步的疑问或需要具体的法律建议，请直接向我咨询。