关于刑事判决被告人退赔的案件申请强制执行是由刑事审判庭移交执行庭还是被害人申请的问题，我可以明确告知您：在刑事判决中，涉及退赔部分的执行，通常是由刑事审判庭直接移送执行庭进行执行的，无需被害人单独申请。以下是具体的分析和法律依据：
执行程序的启动：
- 根据《最高人民法院关于刑事裁判涉财产部分执行的若干规定》第一条和第七条，刑事裁判涉财产部分的执行，包括责令退赔，由人民法院执行机构负责执行。刑事审判部门应当及时移送立案部门审查立案。这意味着，刑事审判庭在作出包含退赔内容的判决后，会直接将该部分移送至执行庭进行执行，无需被害人再行申请。
被害人的权利：
- 被害人在刑事判决中享有获得退赔的权利。如果刑事审判庭未主动移送执行，或者执行过程中出现问题，被害人当然有权向执行庭申请强制执行，以保障自己的合法权益。但通常情况下，这一步骤并非必需，因为刑事审判庭会依法移送执行。
执行措施：
- 一旦执行程序启动，执行庭会采取一系列措施来确保退赔的执行。这些措施包括但不限于查询、冻结存款，查封、扣押、拍卖财产等，以确保被害人的经济损失得到弥补。
综上所述，刑事判决被告人退赔的案件申请强制执行，通常是由刑事审判庭直接移送执行庭进行执行的。被害人无需单独申请，但享有在执行过程中监督、提出异议等权利。如果执行过程中遇到任何问题，被害人可以随时向执行庭反映并寻求帮助。