关于用人单位与员工签署两份不一样的劳动合同这一问题，其核心在于两份合同内容的不一致性可能引发的法律纠纷及处理方式。以下是对此问题的全面分析：
一、核心结论
用人单位与员工签署两份内容不一致的劳动合同，极易引发法律纠纷。处理此类情况时，应首先明确两份合同的具体差异，并依据相关法律法规和双方约定，确定哪份合同更具法律效力，或协商统一合同内容。
二、详细分析
合同差异的处理：
- 首先，需仔细比对两份合同的差异内容，明确是条款表述不同还是实质性权利义务存在区别，如工资待遇、工作岗位、工作地点等重要内容是否有变动。
- 其次，审查合同签订的时间先后。若后签订的合同对前一份合同有变更，需看变更是否符合法律规定和双方约定。若用人单位未经劳动者同意擅自变更关键条款，可能构成违约。
- 再者，查看合同是否都经过双方签字或盖章确认。若存在一份合同未经有效签署，那么其法律效力存疑。
法律效力的确定：
- 通常以最后签订的那份合同为准，但这也并非绝对。若后签合同存在违法或显失公平的情况，前签合同仍可能具有法律效力。
- 若两份合同差异导致纠纷，劳动者应收集相关证据，如工资发放记录、工作证、考勤记录等，以证明实际履行的合同内容。
纠纷解决途径：
- 劳动者可与用人单位协商，统一合同内容或明确解释不一致之处。
- 协商不成时，可向劳动监察部门投诉，要求用人单位改正。
- 若合同差异给劳动者带来损失，劳动者有权通过劳动仲裁或诉讼途径，请求仲裁机构或法院根据具体情况，结合双方实际履行情况、证据等，认定哪份合同有效或确定双方的权利义务。
三、法律建议
- 谨慎签订合同：劳动者在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，确保合同内容的一致性与合法性。
- 保留证据：在合同履行过程中，劳动者应保留好相关证据，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。
- 及时咨询：如遇合同纠纷或其他法律问题，劳动者应及时咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
综上所述，用人单位与员工签署两份不一样的劳动合同是一个复杂的法律问题，需要根据具体情况进行细致分析和处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。