医院行政岗休年假扣绩效是否合法，取决于具体的劳动合同、医院规章制度以及相关法律法规。下面我将从几个方面进行详细分析：

1. 劳动合同约定：

   • 首先，要查看你与医院签订的劳动合同中是否有关于年假和绩效的相关规定。如果劳动合同中明确规定了休年假期间绩效不受影响，那么医院扣绩效就是不合法的。
   • 反之，如果劳动合同中规定了休年假期间绩效可以相应扣减，且该规定不违反法律法规，那么医院按照合同约定扣绩效就是合法的。

2. 医院规章制度：

   • 除了劳动合同，医院内部的规章制度也是判断的重要依据。如果医院规章制度中明确规定了休年假期间绩效的处理方式，且该规章制度已经过合法程序制定并公示，那么医院按照规章制度扣绩效也是合法的。

3. 相关法律法规：

   • 根据《劳动法》和《职工带薪年休假条例》等法律法规，职工在休年假期间应享受与正常工作期间相同的工资收入。这里的“工资收入”通常指的是基本工资，而不一定包括绩效工资。
   • 因此，如果医院扣减的是绩效工资中的非固定部分，且该扣减行为有合理的依据（如绩效考核制度、医院规章制度等），并且不违反法律法规的强制性规定，那么这种扣减可能是合法的。

4. 实际情况判断：

   • 具体是否合法还需要结合你的实际情况来判断。比如，你的绩效工资是如何构成的？休年假期间的工作表现是否影响了绩效？医院扣减绩效的具体依据是什么？
   • 如果医院无故扣减你的绩效工资，或者扣减的依据不合理、不合法，那么你可以通过法律途径来维护自己的权益。

综上所述，医院行政岗休年假扣绩效是否合法，需要综合考虑劳动合同、医院规章制度以及相关法律法规等多个方面。如果你对此有疑问或认为自己的权益受到了侵害，建议及时向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供详细的法律分析和建议。